Endogenous retrovirus (original) (raw)
Endogene Retroviren (ERV) sind Retroviren, die keinen vollständigen Replikationszyklus durchlaufen, sondern als Provirus von Generation zu Generation im Genom des Wirts weitervererbt werden. Man nimmt an, dass sie vor vielen Generationen durch Infektion der Keimbahnzellen von Menschen und anderen Wirbeltieren entstanden sind.
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dbo:abstract | الفيروسات الراجعة الداخلية، هي عناصر فيروسية داخلية في الجينوم تتشابه فيما بينها ويمكن اشتقاقها من الفيروسات الراجعة. توجد هذه الفيروسات بوفرة في جينوم الفقاريات الفكية وتشكل 5-8% من الجينوم البشري (تقديرات أخفض بما يقارب 1%). تُعد الفيروسات الراجعة الداخلية ضمن صف لنمط من الجينات يدعى الينقولات، يمكن أن تُغلف وتُنقل ضمن الجينوم لتلعب دورًا حيويًا في التعبير الجيني والتنظيم. تُعرف الفيروسات الراجعة أيضًا باسم الينقولات الراجعة وتشكل الصف الأول من العناصر. اقترح الباحثون أن الفيروسات الراجعة تطورت من نمط من الجينات القافزة تدعى الينقولات الراجعة، وتضم الفيروسات الراجعة الداخلية، يمكن لهذه الجينات أن تتحور، وبدلًا من الانتقال إلى موقع آخر في الجينوم، بإمكانها أن تصبح فيروسات راجعة خارجية أو ممرضة، ما يعني أنه لم تنشأ جميع الفيروسات الراجعة الداخلية كإدخال بواسطة الفيروسات الراجعة، وإنما يشكل بعضها مصدر المعلومات الجينية في الفيروسات الراجعة التي تتشابه معها. عندما يحدث دمج للدنا الفيروسي في خط جرثومي، يمكن أن تنشأ هنا الفيروسات الراجعة الداخلية، ويمكن لاحقًا أن تصبح ثابتة في تجميعة الجينات للكائنات المضيفة. (ar) Els retrovirus endògens (ERV) són elements vírics endògens del genoma que són similars entre si i que es poden derivar d'un retrovirus. Abundants en genomes de vertebrats, representen fins a un 5-8% del genoma humà, amb estimacions inferiors a l'1%, que es poden empaquetar i moure dins del genoma per jugar un paper vital en l'expressió i la regulació gènica. Els investigadors han suggerit que els retrovirus van evolucionar a partir d'un tipus de gen transposable anomenat retrotransposó, que inclou ERV; aquests gens poden mutar i en lloc de traslladar-se a una altra ubicació del genoma poden arribar a ser exògens o patògens. Això vol dir que no tots els ERV poden haver-se originat com a inserció de retrovirus, però alguns poden haver estat la font d'informació genètica dels retrovirus als quals s'assemblen. (ca) Endogene Retroviren (ERV) sind Retroviren, die keinen vollständigen Replikationszyklus durchlaufen, sondern als Provirus von Generation zu Generation im Genom des Wirts weitervererbt werden. Man nimmt an, dass sie vor vielen Generationen durch Infektion der Keimbahnzellen von Menschen und anderen Wirbeltieren entstanden sind. (de) Endogenous retroviruses (ERVs) are endogenous viral elements in the genome that closely resemble and can be derived from retroviruses. They are abundant in the genomes of jawed vertebrates, and they comprise up to 5–8% of the human genome (lower estimates of ~1%). ERVs are a vertically inherited proviral sequence and a subclass of a type of gene called a transposon, which can normally be packaged and moved within the genome to serve a vital role in gene expression and in regulation. ERVs however lack most transposon functions, are typically not infectious and are often defective genomic remnants of the retroviral replication cycle. They are distinguished as germline provirus retroelements due to their integration and reverse-transcription into the nuclear genome of the host cell. Researchers have suggested that retroviruses evolved from a type of transposon called a retrotransposon, a Class I element; these genes can mutate and instead of moving to another location in the genome they can become exogenous or pathogenic. This means that not all ERVs may have originated as an insertion by a retrovirus but that some may have been the source for the genetic information in the retroviruses they resemble. When integration of viral DNA occurs in the germ-line, it can give rise to an ERV, which can later become fixed in the gene pool of the host population. (en) Un rétrovirus endogène (ERV, de l'anglais : endogenous retrovirus) ou endovirus désigne une séquence du génome d'un organisme stable (c'est-à-dire qui se transmet de génération en génération) et ayant des analogies avec certains rétrovirus (classés, eux, comme exogènes, car leur génome n'est pas présent dans celui de l'organisme). (fr) Los retrovirus endógenos (ERV) son elementos virales endógenos en el genoma que son similares entre sí y pueden ser derivados de un retrovirus. Abundantes en los genomas de los vertebrados, comprenden hasta un 5-8% del genoma humano (estimaciones inferiores de ~ 1 %). Los ERV (por sus siglas en inglés) son una subclase de un tipo de gen llamado transposón, que puede ser empaquetado y movido dentro del genoma para realizar un papel vital en la expresión génica y en la regulación. Los investigadores han sugerido que los retrovirus evolucionaron a partir de un tipo de gen transponible llamado un retrotransposón, que incluye ERV; estos genes pueden mutar y en lugar de moverse a otra ubicación en el genoma pueden llegar a convertirse en exógenos o patógenos. Esto significa que no todos los ERV pueden haberse originado como por la inserción de un retrovirus, sino que algunos pueden haber sido la fuente de información genética de los retrovirus a los que se asemejan. (es) 内在性レトロウイルス (ないざいせいレトロウイルス 英: Endogenous retrovirus, ERV) もしくは内因性レトロウイルス(ないいんせいレトロウイルス)とは、ウイルス以外の生物の生殖細胞のゲノムの中に存在する、ウイルスのゲノムによく似た塩基配列(内在性ウイルス様配列)のうち、レトロウイルスによく似た配列をいう。 過去にレトロウイルスに感染した生物のゲノムにレトロウイルスのゲノムが取り込まれ、それが子孫に受け継がれたものと考えられている。 (ja) Retrovírus endógenos (em inglês: Endogenous retroviruses, ERVs) são no genoma que se assemelham e podem ser derivados de retrovírus. Eles são abundantes nos genomas de vertebrados com mandíbulas e compreendem até 5–8% do genoma humano (estimativas mais baixas de ~ 1%). Os ERVs são uma sequência proviral herdada verticalmente e uma subclasse de uma categoria de gene chamado transposon, que normalmente pode ser empacotado e movido no genoma para servir a um papel vital na expressão gênica e na regulação. Os ERVs, entretanto, não possuem a maior parte da função de transposon, normalmente não são infecciosos e costumam ser remanescentes genômicos defeituosos do ciclo de replicação retroviral. Eles são distinguidos como retroelementos de provírus da linha germinativa devido à sua integração e transcrição reversa no genoma nuclear da célula hospedeira. Os pesquisadores sugeriram que os retrovírus evoluíram de uma categoria de transposon denominado retrotransposon, um elemento de Classe I; esses genes podem sofrer mutação e, em vez de se moverem para outro local no genoma, podem se tornar exógenos ou patogênicos. Isso significa que nem todos os ERVs podem ter se originado como uma inserção de um retrovírus, mas alguns podem ter sido a fonte da informação genética nos retrovírus com os quais se assemelham. Quando a integração do DNA viral ocorre na linha germinativa, pode dar origem a um ERV, que mais tarde pode se fixar no pool gênico da população hospedeira. (pt) Retrowirusy endogenne – są to retrowirusy, które przed milionami lat zainfekowały pierwotne komórki rozrodcze człowieka i innych kręgowców. Dzięki odwrotnej transkryptazie, w postaci DNA włączyły się na stałe do materiału genetycznego organizmu zainfekowanego. Przez miliony lat na skutek licznych mutacji oraz kolejnych infekcji doszło do zwielokrotnienia genomu wirusów, przez co stanowi obecnie znaczną część genomu człowieka jak i innych kręgowców, lecz większość z nich jest uszkodzona i zupełnie nieaktywna. Sekwencje pochodzenia retrowirusowego stanowią około 8% ludzkiego genomu. Przeważająca większość ludzkich retrowirusów endogennych (HERV – ang. Human Endogenous RetroVirus) jest nieaktywna. Najmłodszą rodziną HERV są retrowirusy HERV-K. Na podstawie analizy sekwencji HERV-K udało się odtworzyć aktywnego wirusa. (pl) Ett endogent retrovirus, ERV, är ett retrovirus vars arvsmassa blivit en del av värdorganismens arvsmassa. Denna typ av genetiskt material är vanligen förekommande hos käkförsedda ryggradsdjur. De är rikliga i genomet hos ryggradsdjur, och de utgör upp till 5–8% av det mänskliga genomet (lägre uppskattningar av ~ 1%). ERV är en vertikalt ärftlig proviral sekvens och en underklass av en typ av gen som kallas en transposon, som normalt kan förpackas och flyttas inom genomet för att ha en viktig roll i genuttryck och i genreglering. (sv) 內源性反轉錄病毒(Endogenous retrovirus,簡稱ERV)是脊椎動物基因組中的一類具有長末端重複序列(LTR)的基因元件,與LTR反轉錄轉座子非常相似,但除了gag與pol兩基因外還多了編碼包膜蛋白的env基因,可能源於千萬年前感染細胞的反轉錄病毒,這些反轉錄病毒整合進宿主細胞基因組中,大部分已累積許多突變而不再能組裝成完整病毒顆粒,僅能透過細胞複製垂直傳播而不能在細胞間水平傳播,許多甚至已丟失了開放閱讀框,只剩兩側的LTR,不過有些仍能表現病毒蛋白,甚至有能組裝成顆粒感染其他細胞者。細胞中有許多機制可抑制內源性反轉錄病毒的基因表現,但這些序列仍可能在生殖細胞中與發育早期的胚胎裡轉錄,進而複製增殖,內源性反轉錄病毒的過度表現可能與一些癌症與神經退化性疾病有關。 反轉錄病毒丟失env基因後可能轉為LTR反轉錄轉座子,反之LTR反轉錄轉座子獲得env基因後可能轉為反轉錄病毒,不過文獻中常見混用兩者的狀況,且許多內源性反轉錄病毒丟失了編碼蛋白的序列,有些LTR反轉錄轉座子新獲得類似env蛋白的序列,使兩者差異更趨模糊。有研究發現內源性反轉錄病毒丟失env基因而轉為反轉錄轉座子後,雖不能作為病毒感染其他細胞,但在基因組中增殖的能力大大增加。 (zh) |
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(fr) 内在性レトロウイルス (ないざいせいレトロウイルス 英: Endogenous retrovirus, ERV) もしくは内因性レトロウイルス(ないいんせいレトロウイルス)とは、ウイルス以外の生物の生殖細胞のゲノムの中に存在する、ウイルスのゲノムによく似た塩基配列(内在性ウイルス様配列)のうち、レトロウイルスによく似た配列をいう。 過去にレトロウイルスに感染した生物のゲノムにレトロウイルスのゲノムが取り込まれ、それが子孫に受け継がれたものと考えられている。 (ja) Ett endogent retrovirus, ERV, är ett retrovirus vars arvsmassa blivit en del av värdorganismens arvsmassa. Denna typ av genetiskt material är vanligen förekommande hos käkförsedda ryggradsdjur. De är rikliga i genomet hos ryggradsdjur, och de utgör upp till 5–8% av det mänskliga genomet (lägre uppskattningar av ~ 1%). ERV är en vertikalt ärftlig proviral sekvens och en underklass av en typ av gen som kallas en transposon, som normalt kan förpackas och flyttas inom genomet för att ha en viktig roll i genuttryck och i genreglering. (sv) 內源性反轉錄病毒(Endogenous retrovirus,簡稱ERV)是脊椎動物基因組中的一類具有長末端重複序列(LTR)的基因元件,與LTR反轉錄轉座子非常相似,但除了gag與pol兩基因外還多了編碼包膜蛋白的env基因,可能源於千萬年前感染細胞的反轉錄病毒,這些反轉錄病毒整合進宿主細胞基因組中,大部分已累積許多突變而不再能組裝成完整病毒顆粒,僅能透過細胞複製垂直傳播而不能在細胞間水平傳播,許多甚至已丟失了開放閱讀框,只剩兩側的LTR,不過有些仍能表現病毒蛋白,甚至有能組裝成顆粒感染其他細胞者。細胞中有許多機制可抑制內源性反轉錄病毒的基因表現,但這些序列仍可能在生殖細胞中與發育早期的胚胎裡轉錄,進而複製增殖,內源性反轉錄病毒的過度表現可能與一些癌症與神經退化性疾病有關。 反轉錄病毒丟失env基因後可能轉為LTR反轉錄轉座子,反之LTR反轉錄轉座子獲得env基因後可能轉為反轉錄病毒,不過文獻中常見混用兩者的狀況,且許多內源性反轉錄病毒丟失了編碼蛋白的序列,有些LTR反轉錄轉座子新獲得類似env蛋白的序列,使兩者差異更趨模糊。有研究發現內源性反轉錄病毒丟失env基因而轉為反轉錄轉座子後,雖不能作為病毒感染其他細胞,但在基因組中增殖的能力大大增加。 (zh) الفيروسات الراجعة الداخلية، هي عناصر فيروسية داخلية في الجينوم تتشابه فيما بينها ويمكن اشتقاقها من الفيروسات الراجعة. توجد هذه الفيروسات بوفرة في جينوم الفقاريات الفكية وتشكل 5-8% من الجينوم البشري (تقديرات أخفض بما يقارب 1%). تُعد الفيروسات الراجعة الداخلية ضمن صف لنمط من الجينات يدعى الينقولات، يمكن أن تُغلف وتُنقل ضمن الجينوم لتلعب دورًا حيويًا في التعبير الجيني والتنظيم. تُعرف الفيروسات الراجعة أيضًا باسم الينقولات الراجعة وتشكل الصف الأول من العناصر. اقترح الباحثون أن الفيروسات الراجعة تطورت من نمط من الجينات القافزة تدعى الينقولات الراجعة، وتضم الفيروسات الراجعة الداخلية، يمكن لهذه الجينات أن تتحور، وبدلًا من الانتقال إلى موقع آخر في الجينوم، بإمكانها أن تصبح فيروسات راجعة خارجية أو ممرضة، ما يعني أنه لم تنشأ جميع الفيروسات الراجعة الداخلية كإدخال بواسطة الفيروسات الراجعة، وإنما يشكل (ar) Els retrovirus endògens (ERV) són elements vírics endògens del genoma que són similars entre si i que es poden derivar d'un retrovirus. Abundants en genomes de vertebrats, representen fins a un 5-8% del genoma humà, amb estimacions inferiors a l'1%, que es poden empaquetar i moure dins del genoma per jugar un paper vital en l'expressió i la regulació gènica. Els investigadors han suggerit que els retrovirus van evolucionar a partir d'un tipus de gen transposable anomenat retrotransposó, que inclou ERV; aquests gens poden mutar i en lloc de traslladar-se a una altra ubicació del genoma poden arribar a ser exògens o patògens. Això vol dir que no tots els ERV poden haver-se originat com a inserció de retrovirus, però alguns poden haver estat la font d'informació genètica dels retrovirus als (ca) Endogenous retroviruses (ERVs) are endogenous viral elements in the genome that closely resemble and can be derived from retroviruses. They are abundant in the genomes of jawed vertebrates, and they comprise up to 5–8% of the human genome (lower estimates of ~1%). (en) Los retrovirus endógenos (ERV) son elementos virales endógenos en el genoma que son similares entre sí y pueden ser derivados de un retrovirus. Abundantes en los genomas de los vertebrados, comprenden hasta un 5-8% del genoma humano (estimaciones inferiores de ~ 1 %). Los ERV (por sus siglas en inglés) son una subclase de un tipo de gen llamado transposón, que puede ser empaquetado y movido dentro del genoma para realizar un papel vital en la expresión génica y en la regulación. Los investigadores han sugerido que los retrovirus evolucionaron a partir de un tipo de gen transponible llamado un retrotransposón, que incluye ERV; estos genes pueden mutar y en lugar de moverse a otra ubicación en el genoma pueden llegar a convertirse en exógenos o patógenos. Esto significa que no todos los (es) Retrowirusy endogenne – są to retrowirusy, które przed milionami lat zainfekowały pierwotne komórki rozrodcze człowieka i innych kręgowców. Dzięki odwrotnej transkryptazie, w postaci DNA włączyły się na stałe do materiału genetycznego organizmu zainfekowanego. Przez miliony lat na skutek licznych mutacji oraz kolejnych infekcji doszło do zwielokrotnienia genomu wirusów, przez co stanowi obecnie znaczną część genomu człowieka jak i innych kręgowców, lecz większość z nich jest uszkodzona i zupełnie nieaktywna. (pl) Retrovírus endógenos (em inglês: Endogenous retroviruses, ERVs) são no genoma que se assemelham e podem ser derivados de retrovírus. Eles são abundantes nos genomas de vertebrados com mandíbulas e compreendem até 5–8% do genoma humano (estimativas mais baixas de ~ 1%). Os ERVs são uma sequência proviral herdada verticalmente e uma subclasse de uma categoria de gene chamado transposon, que normalmente pode ser empacotado e movido no genoma para servir a um papel vital na expressão gênica e na regulação. 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