Microsatellite (original) (raw)
Mikrosatelit (též krátké tandemové repetice nebo také STR = short tandem repeats) je označení pro sekvence repetitivní DNA, složené z opakujících se jednotek o velikosti obvykle v rozmezí 2-5 nukleotidů.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | التكرارات المترادفة القصيرة (بالإنجليزية: Microsatellite) هي مناطق على الحمض النووي منقوص الاكسجين تحوي وحدات متكررة طولها 2-6 bp يطلق عليها microsatellites أو simple sequence repeats (SSRs)، لكن التسمية الشائعة هي التكرارات المترادفة القصيرة short tandem repeats (STRs). تستخدم التكرارات المترادفة القصيرة على نطاق واسع لتحديد ملامح الحمض النووي في تشخيص السرطان، وفي تحليل القرابة (وخاصة اختبار الأبوة) وفي تحديد الطب الشرعي. كما أنها تستخدم في تحليل الوصلة الوراثية لتحديد موقع جين أو طفرة مسؤولة عن سمة أو مرض معين، وفي علم الوراثة السكاني لقياس مستويات الارتباط بين السلالات الفرعية والمجموعات والأفراد. (ar) Un microsatèl·lit és una seqüència d'ADN repetitiu en la qual es repeteixen certs motius d'ADN (entre 1 i 6 o més parells de bases de llargada), generalment entre 5 i 50 vegades. Els microsatèl·lits es troben en milers de llocs al llarg del genoma d'un organisme, generalment en zones no codificants de l'ADN. Tenen una taxa de mutació més elevada que d'altres àrees de l'ADN, la qual cosa condueix a una gran diversitat genètica. Els microsatèl·lits també es coneixen com a STR (de l'anglès Short Tandem Repeats) en genètica forense i en genealogia genètica, o bé com a SSR (de l'anglès simple sequence repeats) per part de genetistes vegetals. El nom d'ADN "satèl·lit" fa referència a l'observació primerenca que la centrifugació de l'ADN genòmic en un tub d'assaig separa una voluminosa capa prominent d'ADN d'altres capes "satèl·lit" d'ADN repetitiu que l'acompanyen. Degut a la seva elevada variabilitat, s'utilitzen àmpliament en l'anàlisi genètica per al diagnòstic del càncer, en l'anàlisi de parentiu (especialment en ) i en la identificació forense. També s'utilitzen en l'anàlisi de lligaments genètics per localitzar un gen o una mutació responsable d'una determinada característica o malaltia. Els microsatèl·lits també s'utilitzen en genètica de poblacions per mesurar els nivells de relació entre subespècies, grups i individus. (ca) Mikrosatelit (též krátké tandemové repetice nebo také STR = short tandem repeats) je označení pro sekvence repetitivní DNA, složené z opakujících se jednotek o velikosti obvykle v rozmezí 2-5 nukleotidů. (cs) Αυτό το λήμμα αφοράτην αλληλουχία DNA. Ένας μικροδορυφόρος είναι ένα σύστημα επαναλαμβανόμενων μοτίβων DNA (που κυμαίνονται σε μήκος από ένα έως έξι ή περισσότερα ζεύγη βάσεων), συνήθως 5-50 φορές. Οι μικροδορυφόροι εμφανίζονται σε χιλιάδες θέσεις εντός του γονιδιώματος ενός οργανισμού. Έχουν υψηλότερα ποσοστά μετάλλαξης από άλλες περιοχές του DNA που οδηγεί σε υψηλή γενετική ποικιλομορφία. Οι μικροδορυφόροι αναφέρονται συχνά ως μικρές διαδοχικές επαναλήψεις (short tandem repeats ή STRs) από τους εγκληματολογικούς γενετιστές και στη γενετική γενεαλογία ή ως απλές επαναλήψεις αλληλουχίας (simple sequence repeats ή SSRs από τους γενετιστές φυτών. Μπορείτε να έχετε πρόσβαση σε μια βάση δεδομένων μικροδορυφόρων στο https://data.ccmb.res.in/msdb/ Οι μικροδορυφόροι και τα μεγαλύτερα ξαδέλφια τους, οι μινιδορυφόροι (minisatellites), ταξινομούνται μαζί ως ποικίλου αριθμού διαδοχικές επαναλήψεις (variable number tandem repeat ή VNTR) (μεταβλητός αριθμός διαδοχικών επαναλήψεων DNA). Το όνομα δορυφορικό DNA αναφέρεται στην πρώιμη παρατήρηση ότι η φυγοκέντρηση του γονιδιωματικού DNA σε ένα δοκιμαστικό σωλήνα διαχωρίζει ένα εμφανές στρώμα χύδην DNA από τα συνοδευτικά στρώματα "δορυφόρου" επαναλαμβανόμενου DNA. Χρησιμοποιούνται ευρέως για μελέτη του DNA στη διάγνωση καρκίνου, στην ανάλυση συγγένειας (ιδιαίτερα στην εξέταση πατρότητας) και στην ιατροδικαστική αναγνώριση. Χρησιμοποιούνται επίσης στην ανάλυση γενετικής σύνδεσης για τον εντοπισμό ενός γονιδίου ή μιας μετάλλαξης που είναι υπεύθυνη για ένα δεδομένο χαρακτηριστικό ή ασθένεια. Οι μικροδορυφόροι χρησιμοποιούνται επίσης στο γενετική των πληθυσμών για τη μέτρηση των επιπέδων συγγένειας μεταξύ υποειδών, ομάδων και ατόμων. (el) Mikrosatelliten (synonym Simple Sequence Repeats, SSR, short tandem repeats, STR) sind kurze, meist nichtcodierende DNA-Sequenzen von zwei bis sechs Basenpaaren Länge, die im Genom eines Organismus oft wiederholt werden. Oftmals konzentrieren sich viele Wiederholungen am selben Locus (Position einer Sequenz). Sie kommen gehäuft in Eukaryoten vor. Die STR gehören neben den VNTR (variable number of tandem repeats, ‚variable Anzahl an Tandemwiederholungen‘) zur Gruppe der SSLP (Simple sequence length polymorphism ‚einfacher Sequenzlängenpolymorphismus‘). (de) En genética molecular, los microsatélites (SSR o STR por sus acrónimos en inglés para simple sequence repeat y short tandem repeat) son secuencias de ADN en las que un fragmento (cuyo tamaño va desde dos hasta seis pares de bases) se repite de manera consecutiva. La variación en el número de repeticiones, y no la secuencia repetida, crea diferentes alelos. Generalmente se encuentran en zonas no codificantes del ADN. Son neutros, co-dominantes y poseen una alta tasa de mutación, lo que los hace muy polimórficos. Son utilizados como marcadores moleculares en una gran variedad de aplicaciones en el campo de la genética, como pueden ser parentescos y estudios de poblaciones. Esto se debe a su capacidad para generar una huella genética personal o perfil genético. Cabe destacar que, para cada uno de los STRs que podemos encontrar en el genoma, se establecen en la población frecuencias en el número de repeticiones, es decir, que para cada STR existe un determinado rango en el número de repeticiones "normal" dentro de la población (por ejemplo, entre 10 y 13 repeticiones para un STR concreto), mientras que hay otros números de repeticiones que se establecen con menos frecuencia en ese marcador. (es) Un microsatellite (ou séquence microsatellite) est une séquence d'ADN formée par une répétition continue de motifs composés de 1 à 4 nucléotides le plus souvent. La transmission génétique de ces séquences suit les lois de Mendel de l'hérédité. Ces « motifs » sont très abondants dans tout le génome de tous les eucaryotes (un même microsatellite peut être présent en milliers d'exemplaires dans le génome d'une espèce avec par exemple et en moyenne, un microsatellite di- ou tri-nucléotidique tous les 50 kilobases chez les végétaux supérieurs). Ils sont le plus souvent trouvés au niveau des introns des gènes et au niveau d'exons. La longueur de ces séquences (c'est-à-dire le nombre de répétitions ; de 5 à 100 fois en général) varie selon l'espèce, mais aussi d'un individu à l'autre et d'un allèle à l'autre chez un même individu, voire d'une cellule à l'autre du fait d'« erreurs » au cours de la réplication de l'ADN.Mais la localisation de ces séquences dans le génome est relativement conservée entre espèces phylogénétiquement proches. (fr) A microsatellite is a tract of repetitive DNA in which certain DNA motifs (ranging in length from one to six or more base pairs) are repeated, typically 5–50 times. Microsatellites occur at thousands of locations within an organism's genome. They have a higher mutation rate than other areas of DNA leading to high genetic diversity. Microsatellites are often referred to as short tandem repeats (STRs) by forensic geneticists and in genetic genealogy, or as simple sequence repeats (SSRs) by plant geneticists. Microsatellites and their longer cousins, the minisatellites, together are classified as VNTR (variable number of tandem repeats) DNA. The name "satellite" DNA refers to the early observation that centrifugation of genomic DNA in a test tube separates a prominent layer of bulk DNA from accompanying "satellite" layers of repetitive DNA. They are widely used for DNA profiling in cancer diagnosis, in kinship analysis (especially paternity testing) and in forensic identification. They are also used in genetic linkage analysis to locate a gene or a mutation responsible for a given trait or disease. Microsatellites are also used in population genetics to measure levels of relatedness between subspecies, groups and individuals. (en) Mikrosatelit dalam genetika merupakan suatu urutan basa N pada DNA, terdiri dari dua sampai tujuh basa N (disebut sebagai motif) yang berulang-ulang, dengan atau tanpa sela. Misalnya, motif GAG yang memiliki pengulangan 10 kali atau (GAG)10 akan memiliki bentuk sebagai berikut: GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG. Panjang pengulangan ini bervariasi tergantung individu/varietas dan diwariskan kepada generasi berikutnya. Mikrosatelit dikenal pula sebagai SSR atau Simple Sequence Repeats. Dalam bidang genetika manusia, khususnya dalam aplikasi di bidang kedokteran forensik, mikrosatelit dikenal sebagai STR atau Short Tandem Repeats. Mutasi dapat terjadi terhadap banyaknya pengulangan ini sehingga muncul variasi panjang pengulangan di dalam individu-individu dalam suatu spesies. Variasi ini membuat mikrosatelit dapat digunakan sebagai penanda genetik. Fungsi vital mikrosatelit masih diperdebatkan orang. Gejala pengulangan ini dapat dijumpai pada semua kelompok organisme hidup, termasuk bakteri. DNA plastida dan mitokondria pun memilikinya, sehingga mikrosatelit dianggap sebagai relik evolusi dari masa lalu. Secara logis, mikrosatelit dapat dianggap sebagai "alat keamanan" apabila terjadi kesalahan dalam proses transkripsi. Banyak mikrosatelit terletak pada bagian gen yang disebut intron, yang pada tahap akan dibuang, atau pada bagian nontranskripsi (junk DNA). Dengan demikian, transkripsi akan mengurangi jumlah protein yang tidak berfungsi akibat kesalahan pembacaan. (in) マイクロサテライト(microsatellite)は、細胞核やオルガネラのゲノム上に存在する反復配列で、とくに数塩基の単位配列の繰り返しからなるものである。縦列型反復配列（short tandem repeat; STR)あるいは単純反復配列(simple sequence repeat; SSR）とも呼ばれる。繰り返し回数が多くなると遺伝子もしくはその産物であるタンパク質が不安定になりやすく、疾患の原因となるものも存在する。ゲノム中に広く散在しており、普通は中立で共優性を示すことから、集団遺伝学やDNA鑑定のための遺伝マーカーとして利用されている。 (ja) Sekwencje mikrosatelitarne (ang. short tandem repeats, STR) – , w których podstawowy motyw zawiera od 1–10 do 50 powtórzeń o długości 2–12 pz, a ich długość całkowita wynosi 50-500 pz. Mikrosatelity są rozłożone równomiernie co 6–10 kpz, również w obszarach zajmowanych przez geny. Mogą występować jako powtórzenia sekwencji identycznych np. (AAAGT)5, lub w formie podzielonej krótkimi wstawkami składającymi się z kilku nukleotydów np. (AAAGT)5TCG(AAAGT)5CTGA(AAAGT)5. Istnieją także mikrosatelity złożone jako ciąg dwóch lub więcej typów motywów powtarzających się np. (AAAGT)5(ATG)3(AAAGT)5(ATG)3. Mikrosatelity charakteryzują się małą częstością mutacji zarówno w komórkach rozrodczych, jak i somatycznych. (pl) Short tandem repeats (STR’s) of short tandem repeat polymorphisms (STRP's) (Engels: korte herhalingen achter elkaar) zijn vaak 2, 3 of 4 nucleotiden lang ( di, tri en tetranucleotiden repeats ) en worden gemiddeld 10 tot 100 keer herhaald. Ze komen voor in de intronen of in het junk-DNA. De STR’s worden dus niet vertaald naar eiwitten, maar horen wel aanwezig te zijn voor het functioneren van een gen. Als STR’s te lang of te kort zijn kan dit een ziekte of aandoening ten gevolgen hebben doordat de functie van het gen dat in de buurt ligt verstoord wordt. De eerst gevonden en meest voorkomende repeat is: CA CA CA. Deze komt om de paar duizend basenparen voor. STR’s zijn zeer polymorf en het aantal repeats in een bepaalde STR verschilt van persoon tot persoon. Dit komt doordat er gemakkelijk een repeat bij gemaakt kan worden (insertie) of dat er een verwijderd wordt (deletie). STR’s worden dan ook gebruikt bij vaderschapstests en bij de identificatie van personen, omdat iedereen een uniek profiel heeft van de lengte van verschillende STR’s. Er komen verschillende soorten STR’s voor van simpel CA CA CA tot zeer complex GTACATG GTACATG GTACATG. (nl) Een microsatelliet (SSR - Simple Sequence Repeats) bestaat uit korte stukjes niet coderend (niet voor eiwitsynthese zorgend) DNA, die echter soms wel een duidelijke functie hebben. Zo'n kort stukje wordt in het Engels een repeat genoemd. Deze is dikwijls minder dan 150 baseparen lang en wordt vele malen binnen het genoom van een organisme herhaald. De microsatellieten hebben de neiging om vaak op dezelfde plaats van het genoom voor te komen. (nl) Si definiscono microsatelliti (o Short Tandem Repeats o STR, conosciuti anche come Simple Sequence Repeats o SSR, o come Short Tandem Repeat Polymorphism o STRP) sequenze ripetute di DNA non codificante costituiti da unità di ripetizione molto corte (1-5 bp) disposte secondo una ripetizione in tandem, utilizzabili come marcatori molecolari di loci. La loro presenza nel genoma umano non influisce per più del 3%, ma si pensa che comunque essi svolgano una funzione essenziale per la struttura dei cromosomi. I microsatelliti presentano un alto livello di polimorfismo e sono marcatori informativi negli studi di genetica di popolazione, comprendenti approfondimenti dal livello individuale a quello di specie strettamente affini, e nella genetica forense. Infatti, grazie allo studio dei microsatelliti, è possibile creare un profilo del DNA (DNA profiling o impronta genetica) grazie al quale individuare un soggetto. Il confronto genetico potrà essere effettuato confrontando la diversa lunghezza dei microsatelliti presenti in individui differenti. Tali differenze caratterizzano il polimorfismo di ripetizione. Essi sono inoltre utilizzati come marcatori molecolari negli studi sulla duplicazione dei geni o sulla loro eliminazione e sulla selezione assistita da marcatori. (it) Microssatélites são unidades de repetição de pares de bases do ADN (AT, GC), que são utilizados como marcador genético em estudos de parentesco, as migrações humanas e de origem humana. Os microssatélites apresentam taxas mais altas de mutação genética em relação a outras partes do ADN e, portanto, perfeito para estudar ancestralidade humana. Eles são basicamente loci polimórficos presentes no ADN nuclear e ADN organela que consistem em unidades repetitivas 3-7 bases de comprimento. O conceito de marcadores está intimamente ligado à incapacidade humana de definir, com precisão, os fatores genéticos que governam as características fenotípicas de seu interesse. É prática comum no melhoramento genético de plantas e animais tentar identificar caracteres facilmente detectáveis, como cor de flor, que estejam fortemente correlacionados com uma característica de difícil mensuração, como a resistência a determinada doença. Se a associação, de fato, existe, o caráter qualitativo é um marcador fenotípico ligado à resistência. Neste caso, é muito provável que pelo menos um gene, que determine o caráter qualitativo esteja localizado no mesmo grupo de ligação dos genes que governam a resistência. Partindo desse princípio, qualquer fragmento de ADN próximo ao gene de resistência poderia ser utilizado como marcador, que neste caso é denominado marcador molecular. A grande vantagem dos marcadores moleculares de ADN, com relação a outros tipos de marcadores é a sua abundância, a sua insensibilidade aos fatores do ambiente e o fato de o ADN estar presente em todas as células do organismo. (pt) Mikrosatelliter är DNA-segment som består av sekvenser av 1-6 baspar som repeteras i en lång följd. Mutationshastigheten i segmenten är hög. En typisk mutation resulterar i att en repetition tas bort eller läggs till, och längden på sekvensen varierar därför kraftigt mellan individer. Vid ett mikrosatellitlocus finns det många fler alleler än vid t.ex. ett SNP-locus. Mikrosatelliter benämns ofta STR (eng. short tandem repeats, korta tandemrepetitioner) av rättsmedicinska genetiker och inom genetisk genealogi, eller som SSR (eng. simple sequence repeats, enkla sekvensrepetitioner) av växtgenetiker. DNA-analys av vanligt förekommande mikrosatelliter (STR-avsnitt) på Y-kromosomen är en billig och säker metod för exempelvis faderskapsundersökningar. Mikrosatelliter används även till att t.ex. studera genetisk variation. (sv) 微衛星（英語：microsatellite），亦称为简单重复序列（Simple Sequence Repeats，SSR(s)）或短串联重复序列（short tandem repeats，STR(s)），是多型性的一種類型。指兩個或多個核苷酸重複排列，且不同的重複序列相鄰的形式，長度約2到10個鹼基對，常見於非編碼的內含子中。 由于重复单位及重复次数不同，使其在不同种族，不同人群之间的分布具有很大差异性，构成了STR遗传多态性。不同个体之间在一个同源STR位点的重复次数不同。通过识别基因组在特定位点的特定序列重复，可能创建一个个人基因档案。目前已经有超过10000个STR位点被公开。STR分析法已经成为法医学领域个体识别和亲权鉴定的重要分析方法，可應用於司法案件調查，也就是遺傳指紋分析。 (zh) Микросателли́ты, или короткие тандемные (простые) повторы, — варьирующие участки (локусы) в ядерной ДНК и ДНК органелл (митохондрий и пластид), состоящие из тандемно повторяющихся мономеров длиной меньше 9 пар оснований и образующие поля менее 1 тысячи пар оснований. Являются широко распространёнными молекулярными маркерами в генетических и геномных исследованиях. (ru) Мікросателіти, також відомі як прості повтори послідовності (англ. Simple Sequence Repeats, SSR) або короткі тандемні повтори (англ. short tandem repeats, STR) — один з типів тандемних повторів, поліморфні ділянки ДНК геномів всіх або більшості організмів, що складаються з повторів 1-6 п.н (пар основ) довжиною (різні джерела вказують на довжину від 1-2 до 4-10 bp), що повторюються 5-50 раз. Вони зазвичай нейтральні, і зазвичай розташовані в районах некодуючої ДНК. Мікросателіти та довші мінісателіти, разом класифікуються як VNTR (variable number of tandem repeats) ДНК. Мікросателіти виникають у тисячах місць у геномі організму. Вони мають більш високий рівень мутацій, ніж інші ділянки ДНК, що призводить до високої генетичної різноманітності. Варіабельність кількості повторів в одному мікросателіті приводить до того, що їх число є унікальним для кожного індивідуума, що дозволяє використання мікросателітів як генетичного маркера. Досліджуючи місцеположення мікросателітів та кількість повторів, можна скласти унікальний генетичний «профайл» або ідентифікаційний запис індивідуума. Зараз відомо понад 10 тис. мікросателітів в геномі людини, а їх аналіз широко використовується в методі генетичного фінґерпринтингу в кріміналістиці, для тесту на батьківство, при діагностиці раку та в інших прикладних та фундаментальних дослідженнях. Вони також використовуються в аналізі генетичного зв’язку, щоб знайти ген або мутацію, відповідальну за певну ознаку чи хворобу. Мікросателіти також використовуються в популяційній генетиці для вимірювання рівнів спорідненості між підвидами, групами та особинами. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/STR-Slippage_Dr.Peter_Forster.jpg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://alggen.lsi.upc.edu/recerca/search/mrepatt/ http://atgc.lirmm.fr/star http://finder.sourceforge.net/ http://kbrin.a-bldg.louisville.edu/cgi-bin/Zv8/getRepeats.cgi%3FLinkageGroup=ALL&SeqBeg=47697593&SeqEnd=49399415&RptLen=ALL/ http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/misa.html http://ssr.nwisrl.ars.usda.gov/ http://www.dna-algo.co.za/downloads.htm http://www.kofler.or.at/bioinformatics/SciRoKo/index.html http://www.repeatmasker.org/ https://data.ccmb.res.in/msdb/ https://stripy.org/database https://web.archive.org/web/20060404015058/http:/bioinf.dms.med.uniroma1.it/JSTRING/ https://web.archive.org/web/20060709203109/http:/www.biophp.org/minitools/microsatellite_repeats_finder/demo.php https://web.archive.org/web/20060712070732/http:/strand.imb.ac.ru/swan/index.html https://web.archive.org/web/20101020172857/http:/www.csufresno.edu/ssrfinder/ http://bioinfo.lifl.fr/mreps https://semanticscholar.org/paper/f8e3169b64fb3ef3be07cf479496de2e5369c3ba http://www.cdfd.org.in/imex http://www.sci.brooklyn.cuny.edu/~sokol/tandem http://www.bioinformatics.org/poly/ http://www.rub.de/spezzoo/cm/cm_phobos.htm http://tandem.bu.edu/trf/trf.html https://zenodo.org/record/896811 http://edoc.mpg.de/get.epl%3Ffid=61177&did=293463&ver=0 |
| dbo:wikiPageID | 44259 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 61042 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1118174525 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Amelogenin dbr:Primer_(molecular_biology) dbr:List_of_biological_databases dbr:Mutation dbr:Mendelian_inheritance dbr:Pristionchus_pacificus dbr:Base_pairs dbr:Desert_locust dbr:Huntington's_disease dbr:Josef_Mengele dbr:DNA dbr:DNA_paternity_testing dbr:DNA_polymerase dbr:DNA_profiling dbr:United_Kingdom dbr:University_of_Leicester dbr:Intron dbr:Polymerase_chain_reaction dbr:Null_allele dbr:Silver_stain dbr:Colorectal_cancer dbr:Gel_electrophoresis dbr:Gene_duplication dbr:Gene_flow dbr:Genealogical_DNA_test dbr:Genetic_diversity dbr:Genetic_linkage dbr:Genetic_marker dbr:Genome dbr:Natural_selection dbr:Nuclear_DNA dbr:Oligonucleotide dbr:Genetic_genealogy dbr:Morphology_(biology) dbr:Homologous_chromosomes dbr:Annealing_(biology) dbr:Cloning dbr:Cloning_vector dbr:Cloverleaf_model_of_tRNA dbr:Zebrafish dbr:Friedreich's_ataxia dbr:Population_genetics dbr:Population_size dbr:Tandem_repeat dbr:Transposon dbr:Microsatellite_enrichment dbr:Microsatellite_instability dbr:Mutation_rate dbr:CODIS dbr:Aglet dbr:Thymine dbr:Codon dbr:Local_adaptation dbr:Locus_(genetics) dbr:Strbase dbr:Acrylamide dbr:Adenine dbr:Alec_Jeffreys dbr:Cytosine dbr:DNA_sequencing dbc:Repetitive_DNA_sequences dbr:Escherichia_coli dbr:Ethidium_bromide dbr:Ewing's_sarcoma dbr:FASTA_format dbr:Fluorescence dbr:Forensics dbr:Capillary_electrophoresis dbr:Biochemical dbr:Fragile_X_syndrome dbr:Genetic_fingerprint dbr:Medical_privacy dbr:RNA dbr:Guanine dbr:Bacteriophage dbr:Telomeres dbr:Tetrapod dbr:Hand-Foot-Genital_Syndrome dbr:Variable_number_tandem_repeat dbc:Genetics dbr:Agarose_gel_electrophoresis dbc:Forensic_genetics dbr:Junk_DNA dbr:Coding_region dbr:Y_chromosome dbr:Mitosis dbr:Polymorphism_(biology) dbr:Circadian_clock dbr:Fimbria_(bacteriology) dbr:DNA_intercalation dbr:Sequence_motif dbr:Kinship dbr:Population_bottleneck dbr:Loss_of_heterozygosity dbr:Biological_marker dbr:Marker_assisted_selection dbr:Minisatellite dbr:Satellite_DNA dbr:Simple_sequence_length_polymorphism dbr:Single-nucleotide_polymorphism dbr:Species dbr:Long_interspersed_nucleotide_elements dbr:Plasmid dbr:Snpstr dbr:Fixation_index dbr:Phylogeography dbr:UgMicroSatdb dbr:Y-STR dbr:Trinucleotide_repeat_disorder dbr:RNA_world dbr:Spliceosome dbr:Next_generation_sequencing dbr:Point_mutations dbr:Intronic dbr:UK_National_DNA_Database dbr:Trait_(biology) dbr:Tumour dbr:Bone_marrow_transplant dbr:SGM+ dbr:Genetic_fingerprinting dbr:Forensic_genetics dbr:Genetic_deletion dbr:Short_interspersed_element dbr:Mobile_element dbr:File:Str_profile.jpg dbr:File:Short_Tandem_Repeat_(STR)_analysis.png dbr:File:Consensus_neighbor-joining_tree_o...ns_and_six_chimpanzee_populations.svg dbr:File:PAGE_AgStain_Microsat.jpg dbr:File:STR-Slippage_Dr.Peter_Forster.jpg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:About dbt:Authority_control dbt:Citation_needed dbt:Cite_journal dbt:Cmn dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Repeated_sequence |
| dcterms:subject | dbc:Repetitive_DNA_sequences dbc:Genetics dbc:Forensic_genetics |
| gold:hypernym | dbr:Tract |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Place yago:Abstraction100002137 yago:Arrangement107938773 yago:Group100031264 yago:Ordering108456993 yago:Sequence108459252 yago:Series108457976 yago:WikicatRepetitiveDNASequences |
| rdfs:comment | Mikrosatelit (též krátké tandemové repetice nebo také STR = short tandem repeats) je označení pro sekvence repetitivní DNA, složené z opakujících se jednotek o velikosti obvykle v rozmezí 2-5 nukleotidů. (cs) Mikrosatelliten (synonym Simple Sequence Repeats, SSR, short tandem repeats, STR) sind kurze, meist nichtcodierende DNA-Sequenzen von zwei bis sechs Basenpaaren Länge, die im Genom eines Organismus oft wiederholt werden. Oftmals konzentrieren sich viele Wiederholungen am selben Locus (Position einer Sequenz). Sie kommen gehäuft in Eukaryoten vor. Die STR gehören neben den VNTR (variable number of tandem repeats, ‚variable Anzahl an Tandemwiederholungen‘) zur Gruppe der SSLP (Simple sequence length polymorphism ‚einfacher Sequenzlängenpolymorphismus‘). (de) マイクロサテライト(microsatellite)は、細胞核やオルガネラのゲノム上に存在する反復配列で、とくに数塩基の単位配列の繰り返しからなるものである。縦列型反復配列（short tandem repeat; STR)あるいは単純反復配列(simple sequence repeat; SSR）とも呼ばれる。繰り返し回数が多くなると遺伝子もしくはその産物であるタンパク質が不安定になりやすく、疾患の原因となるものも存在する。ゲノム中に広く散在しており、普通は中立で共優性を示すことから、集団遺伝学やDNA鑑定のための遺伝マーカーとして利用されている。 (ja) Sekwencje mikrosatelitarne (ang. short tandem repeats, STR) – , w których podstawowy motyw zawiera od 1–10 do 50 powtórzeń o długości 2–12 pz, a ich długość całkowita wynosi 50-500 pz. Mikrosatelity są rozłożone równomiernie co 6–10 kpz, również w obszarach zajmowanych przez geny. Mogą występować jako powtórzenia sekwencji identycznych np. (AAAGT)5, lub w formie podzielonej krótkimi wstawkami składającymi się z kilku nukleotydów np. (AAAGT)5TCG(AAAGT)5CTGA(AAAGT)5. Istnieją także mikrosatelity złożone jako ciąg dwóch lub więcej typów motywów powtarzających się np. (AAAGT)5(ATG)3(AAAGT)5(ATG)3. Mikrosatelity charakteryzują się małą częstością mutacji zarówno w komórkach rozrodczych, jak i somatycznych. (pl) Een microsatelliet (SSR - Simple Sequence Repeats) bestaat uit korte stukjes niet coderend (niet voor eiwitsynthese zorgend) DNA, die echter soms wel een duidelijke functie hebben. Zo'n kort stukje wordt in het Engels een repeat genoemd. Deze is dikwijls minder dan 150 baseparen lang en wordt vele malen binnen het genoom van een organisme herhaald. De microsatellieten hebben de neiging om vaak op dezelfde plaats van het genoom voor te komen. (nl) 微衛星（英語：microsatellite），亦称为简单重复序列（Simple Sequence Repeats，SSR(s)）或短串联重复序列（short tandem repeats，STR(s)），是多型性的一種類型。指兩個或多個核苷酸重複排列，且不同的重複序列相鄰的形式，長度約2到10個鹼基對，常見於非編碼的內含子中。 由于重复单位及重复次数不同，使其在不同种族，不同人群之间的分布具有很大差异性，构成了STR遗传多态性。不同个体之间在一个同源STR位点的重复次数不同。通过识别基因组在特定位点的特定序列重复，可能创建一个个人基因档案。目前已经有超过10000个STR位点被公开。STR分析法已经成为法医学领域个体识别和亲权鉴定的重要分析方法，可應用於司法案件調查，也就是遺傳指紋分析。 (zh) Микросателли́ты, или короткие тандемные (простые) повторы, — варьирующие участки (локусы) в ядерной ДНК и ДНК органелл (митохондрий и пластид), состоящие из тандемно повторяющихся мономеров длиной меньше 9 пар оснований и образующие поля менее 1 тысячи пар оснований. Являются широко распространёнными молекулярными маркерами в генетических и геномных исследованиях. (ru) التكرارات المترادفة القصيرة (بالإنجليزية: Microsatellite) هي مناطق على الحمض النووي منقوص الاكسجين تحوي وحدات متكررة طولها 2-6 bp يطلق عليها microsatellites أو simple sequence repeats (SSRs)، لكن التسمية الشائعة هي التكرارات المترادفة القصيرة short tandem repeats (STRs). (ar) Un microsatèl·lit és una seqüència d'ADN repetitiu en la qual es repeteixen certs motius d'ADN (entre 1 i 6 o més parells de bases de llargada), generalment entre 5 i 50 vegades. Els microsatèl·lits es troben en milers de llocs al llarg del genoma d'un organisme, generalment en zones no codificants de l'ADN. Tenen una taxa de mutació més elevada que d'altres àrees de l'ADN, la qual cosa condueix a una gran diversitat genètica. Els microsatèl·lits també es coneixen com a STR (de l'anglès Short Tandem Repeats) en genètica forense i en genealogia genètica, o bé com a SSR (de l'anglès simple sequence repeats) per part de genetistes vegetals. (ca) Αυτό το λήμμα αφοράτην αλληλουχία DNA. Ένας μικροδορυφόρος είναι ένα σύστημα επαναλαμβανόμενων μοτίβων DNA (που κυμαίνονται σε μήκος από ένα έως έξι ή περισσότερα ζεύγη βάσεων), συνήθως 5-50 φορές. Οι μικροδορυφόροι εμφανίζονται σε χιλιάδες θέσεις εντός του γονιδιώματος ενός οργανισμού. Έχουν υψηλότερα ποσοστά μετάλλαξης από άλλες περιοχές του DNA που οδηγεί σε υψηλή γενετική ποικιλομορφία. Οι μικροδορυφόροι αναφέρονται συχνά ως μικρές διαδοχικές επαναλήψεις (short tandem repeats ή STRs) από τους εγκληματολογικούς γενετιστές και στη γενετική γενεαλογία ή ως απλές επαναλήψεις αλληλουχίας (simple sequence repeats ή SSRs από τους γενετιστές φυτών. Μπορείτε να έχετε πρόσβαση σε μια βάση δεδομένων μικροδορυφόρων στο https://data.ccmb.res.in/msdb/ (el) En genética molecular, los microsatélites (SSR o STR por sus acrónimos en inglés para simple sequence repeat y short tandem repeat) son secuencias de ADN en las que un fragmento (cuyo tamaño va desde dos hasta seis pares de bases) se repite de manera consecutiva. La variación en el número de repeticiones, y no la secuencia repetida, crea diferentes alelos. (es) A microsatellite is a tract of repetitive DNA in which certain DNA motifs (ranging in length from one to six or more base pairs) are repeated, typically 5–50 times. Microsatellites occur at thousands of locations within an organism's genome. They have a higher mutation rate than other areas of DNA leading to high genetic diversity. Microsatellites are often referred to as short tandem repeats (STRs) by forensic geneticists and in genetic genealogy, or as simple sequence repeats (SSRs) by plant geneticists. (en) Un microsatellite (ou séquence microsatellite) est une séquence d'ADN formée par une répétition continue de motifs composés de 1 à 4 nucléotides le plus souvent. La transmission génétique de ces séquences suit les lois de Mendel de l'hérédité. (fr) Mikrosatelit dalam genetika merupakan suatu urutan basa N pada DNA, terdiri dari dua sampai tujuh basa N (disebut sebagai motif) yang berulang-ulang, dengan atau tanpa sela. Misalnya, motif GAG yang memiliki pengulangan 10 kali atau (GAG)10 akan memiliki bentuk sebagai berikut: GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG. Panjang pengulangan ini bervariasi tergantung individu/varietas dan diwariskan kepada generasi berikutnya. Mikrosatelit dikenal pula sebagai SSR atau Simple Sequence Repeats. Dalam bidang genetika manusia, khususnya dalam aplikasi di bidang kedokteran forensik, mikrosatelit dikenal sebagai STR atau Short Tandem Repeats. (in) Si definiscono microsatelliti (o Short Tandem Repeats o STR, conosciuti anche come Simple Sequence Repeats o SSR, o come Short Tandem Repeat Polymorphism o STRP) sequenze ripetute di DNA non codificante costituiti da unità di ripetizione molto corte (1-5 bp) disposte secondo una ripetizione in tandem, utilizzabili come marcatori molecolari di loci. La loro presenza nel genoma umano non influisce per più del 3%, ma si pensa che comunque essi svolgano una funzione essenziale per la struttura dei cromosomi. (it) Short tandem repeats (STR’s) of short tandem repeat polymorphisms (STRP's) (Engels: korte herhalingen achter elkaar) zijn vaak 2, 3 of 4 nucleotiden lang ( di, tri en tetranucleotiden repeats ) en worden gemiddeld 10 tot 100 keer herhaald. Ze komen voor in de intronen of in het junk-DNA. De STR’s worden dus niet vertaald naar eiwitten, maar horen wel aanwezig te zijn voor het functioneren van een gen. (nl) Microssatélites são unidades de repetição de pares de bases do ADN (AT, GC), que são utilizados como marcador genético em estudos de parentesco, as migrações humanas e de origem humana. Os microssatélites apresentam taxas mais altas de mutação genética em relação a outras partes do ADN e, portanto, perfeito para estudar ancestralidade humana. Eles são basicamente loci polimórficos presentes no ADN nuclear e ADN organela que consistem em unidades repetitivas 3-7 bases de comprimento. (pt) Mikrosatelliter är DNA-segment som består av sekvenser av 1-6 baspar som repeteras i en lång följd. Mutationshastigheten i segmenten är hög. En typisk mutation resulterar i att en repetition tas bort eller läggs till, och längden på sekvensen varierar därför kraftigt mellan individer. Vid ett mikrosatellitlocus finns det många fler alleler än vid t.ex. ett SNP-locus. Mikrosatelliter benämns ofta STR (eng. short tandem repeats, korta tandemrepetitioner) av rättsmedicinska genetiker och inom genetisk genealogi, eller som SSR (eng. simple sequence repeats, enkla sekvensrepetitioner) av växtgenetiker. (sv) Мікросателіти, також відомі як прості повтори послідовності (англ. Simple Sequence Repeats, SSR) або короткі тандемні повтори (англ. short tandem repeats, STR) — один з типів тандемних повторів, поліморфні ділянки ДНК геномів всіх або більшості організмів, що складаються з повторів 1-6 п.н (пар основ) довжиною (різні джерела вказують на довжину від 1-2 до 4-10 bp), що повторюються 5-50 раз. Вони зазвичай нейтральні, і зазвичай розташовані в районах некодуючої ДНК. Мікросателіти та довші мінісателіти, разом класифікуються як VNTR (variable number of tandem repeats) ДНК. (uk) |
| rdfs:label | التكرارات المترادفة القصيرة (ar) Microsatèl·lit (ca) Mikrosatelit (cs) Short Tandem Repeat (de) Mikrosatellit (de) Μικροδορυφόρος (βιολογία) (el) Microsatélite (es) Microsatellite (biologie) (fr) Mikrosatelit (in) Microsatelliti (it) Microsatellite (en) マイクロサテライト (ja) Microsatelliet (nl) Short tandem repeat (nl) Sekwencje mikrosatelitarne (pl) Microssatélite (pt) Mikrosatellit (sv) Микросателлиты (ru) Короткий тандемный повтор (ru) Мікросателіти (uk) 微衛星 (zh) |
| owl:sameAs | freebase:Microsatellite yago-res:Microsatellite wikidata:Microsatellite wikidata:Microsatellite dbpedia-ar:Microsatellite http://bs.dbpedia.org/resource/Mikrosatelit dbpedia-ca:Microsatellite dbpedia-cs:Microsatellite dbpedia-de:Microsatellite dbpedia-de:Microsatellite dbpedia-el:Microsatellite dbpedia-es:Microsatellite dbpedia-et:Microsatellite dbpedia-fa:Microsatellite dbpedia-fi:Microsatellite dbpedia-fr:Microsatellite dbpedia-gl:Microsatellite dbpedia-he:Microsatellite http://hi.dbpedia.org/resource/अनुबद्ध_शृंखला http://hi.dbpedia.org/resource/माइक्रोसेटेलाइट dbpedia-id:Microsatellite dbpedia-it:Microsatellite dbpedia-ja:Microsatellite dbpedia-nl:Microsatellite dbpedia-nl:Microsatellite dbpedia-pl:Microsatellite dbpedia-pt:Microsatellite dbpedia-ro:Microsatellite dbpedia-ru:Microsatellite dbpedia-ru:Microsatellite dbpedia-sh:Microsatellite dbpedia-sk:Microsatellite dbpedia-sr:Microsatellite dbpedia-sv:Microsatellite dbpedia-tr:Microsatellite dbpedia-uk:Microsatellite http://ur.dbpedia.org/resource/خرد_سیارچہ dbpedia-zh:Microsatellite https://global.dbpedia.org/id/2V3ZY |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Microsatellite?oldid=1118174525&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Consensus_neighbor-jo...ns_and_six_chimpanzee_populations.svg wiki-commons:Special:FilePath/PAGE_AgStain_Microsat.jpg wiki-commons:Special:FilePath/STR-Slippage_Dr.Peter_Forster.jpg wiki-commons:Special:FilePath/Short_Tandem_Repeat_(STR)_analysis.png wiki-commons:Special:FilePath/Str_profile.jpg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Microsatellite |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:Satellite_(disambiguation) |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:STRP dbr:Microsatellites dbr:Short_tandem_repeat dbr:Simple_Sequence_Repeat dbr:Micro-satellite_analysis dbr:Microsatellite_analysis dbr:Short_Tandem_Repeat dbr:Simple_sequence_repeat dbr:Micro-satellite dbr:Microsatellite_(genetics) dbr:Microsatellite_DNA dbr:Microsatellite_repeats dbr:Nucleic_acid_repetitive_sequence dbr:Simple_Sequence_Repeats dbr:Simple_sequence_repeats dbr:Single_tandem_repeat dbr:Single_tandem_repeats dbr:Inter-simple_sequence_repeat dbr:Short_Tandem_Repeats dbr:Short_tandem_repeat_polymorphism dbr:Short_tandem_repeats dbr:CA_repeat |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Cat dbr:Prickly_forest_skink dbr:Puerto_Rican_amazon dbr:Satélite_Tecnológico dbr:Scarlet_macaw dbr:Scoliosis dbr:Epigenetic_clock dbr:Epilepsy-intellectual_disability_in_females dbr:Monogamy dbr:Paternal_age_effect dbr:STRP dbr:Black-throated_blue_warbler dbr:Arctic_wolf dbr:Hormosira dbr:Human_Y-chromosome_DNA_haplogroup dbr:List_of_Iberian_horse_breeds dbr:Renaud_Piarroux dbr:Cumberland_Sound_beluga dbr:Cyclospora_cayetanensis dbr:Cyprinodon_julimes dbr:D-loop_replication dbr:DNA_Specimen_Provenance_Assignment dbr:DNA_barcoding_in_diet_assessment dbr:DNA_history_of_Egypt dbr:DNA_profiling dbr:DNA_sequencer dbr:Ukrainian_Grey dbr:VLS-1_V02 dbr:DeCODE_genetics dbr:EWS/FLI dbr:Integrated_Coastal_Surveillance_System dbr:Inverted_repeat dbr:Libby_Liggins dbr:Null_allele dbr:Premutation dbr:Pink-tailed_worm-lizard dbr:Mengtian_module dbr:SACI-1 dbr:Chestnut-banded_plover dbr:Gene_flow dbr:Genetic_equilibrium dbr:Genetic_history_of_Indigenous_peoples_of_the_Americas dbr:Genetic_privacy dbr:Genetics_and_archaeogenetics_of_South_Asia dbr:Genome_skimming dbr:Genotype dbr:Newfoundland_pony dbr:Opioid_use_disorder dbr:Worker_policing dbr:Coffea dbr:El_Hierro_Launch_Centre dbr:Gene_polymorphism dbr:Genetic_history_of_East_Asians dbr:Genetic_studies_on_Croats dbr:Glossary_of_genetics dbr:Glossary_of_genetics_(M−Z) dbr:Greater_spotted_eagle dbr:Brachygastra_mellifica dbr:Concord_grape dbr:Constitutive_heterochromatin dbr:Copy_number_variation dbr:Coregonus_fontanae dbr:Eric_Yirenkyi_Danquah dbr:1981_in_science dbr:Ann_T._Bowling dbr:Araguaian_river_dolphin dbr:Sloshsat-FLEVO dbr:Smooth_newt dbr:Combined_DNA_Index_System dbr:Common_side-blotched_lizard dbr:Zebrafish dbr:Iberian_wolf dbr:Macrosatellite dbr:Tandem_repeat dbr:Median_wasp dbr:Microsatellite_instability dbr:Mutation_bias dbr:Banksia_brownii dbr:Banksia_integrifolia dbr:Bulgarian_Turks dbr:Buša dbr:Centre_for_Cellular_and_Molecular_Biology dbr:Tiangong_space_station dbr:Timeline_of_Philippine_history dbr:Dolichovespula_sylvestris dbr:Dracaena_umbraculifera dbr:Ganoderma_orbiforme dbr:Hartebeest dbr:K-mer dbr:Landscape_genetics dbr:List_of_Brazilian_satellites dbr:London_Underground_mosquito dbr:Wallace's_tarsier dbr:Aedes_taeniorhynchus dbr:Albert_Erives dbr:Alec_Jeffreys dbr:Alpaca dbr:Ancient_Egyptian_race_controversy dbr:DNAPrint_Genomics dbr:EduSAT dbr:Eyesat-1 dbr:Noma_horse dbr:Othram dbr:Captive_breeding dbr:Chatham_parakeet dbr:Chelonoidis_niger_donfaustoi dbr:Dictyochloropsis dbr:Direct_repeat dbr:Forensic_identification dbr:Frameshift_mutation dbr:Haplogroup_G-FGC7535 dbr:Knysna_seahorse dbr:Sumatran_tiger dbr:List_of_Portuguese_wine_grape_varieties dbr:Ramesses_III dbr:Red-handed_howler dbr:Reflector_(microsatellite) dbr:Smallpox dbr:Haplogroup_E-M2 dbr:Haplogroup_E-M215_(Y-DNA) dbr:Haplogroup_E-V68 dbr:Haplogroup_R1a dbr:Hereditary_nonpolyposis_colorectal_cancer dbr:Hickatee dbr:Israel_Space_Agency dbr:Variable_number_tandem_repeat dbr:Smelowskia_americana dbr:2018_in_the_Philippines dbr:Asteroid_impact_avoidance dbr:ASPM_(gene) dbr:ASUDAS dbr:Adriatic_sturgeon dbr:Laboratory_Cabin_Module dbr:Blue_Mountains_water_skink dbr:Blue_cod dbr:Sunil_Kumar_Verma dbr:Symbiodinium dbr:Coccidioides_posadasii dbr:Coccothrinax_jimenezii dbr:Mitochondrial_DNA dbr:Sakalava_rail dbr:Salmo_dentex dbr:Dhole dbr:Diethard_Tautz dbr:Dog_breed dbr:Domestication_of_the_dog dbr:Artemia_parthenogenetica dbr:Bombus_pensylvanicus dbr:Sputnix dbr:Greater_long-tailed_hamster dbr:Human_genetic_clustering dbr:ID4 dbr:Iberian_lynx dbr:Koi dbr:Kári_Stefánsson dbr:Microsatellites dbr:Nyala dbr:Ocelot dbr:Orbiting_Binary_Black_Hole_Investigation_Satellite dbr:Oryza_sativa dbr:Canadian_horse dbr:Carya_cordiformis dbr:Segugio_Maremmano dbr:Segugio_dell'Appennino dbr:Yonaguni_horse dbr:MSH2 dbr:Minisatellite dbr:Satellite dbr:Satellite_(disambiguation) dbr:Satellite_DNA dbr:Short_tandem_repeat dbr:Simple_Sequence_Repeat dbr:Single-nucleotide_polymorphism dbr:Slipped_strand_mispairing dbr:Stepwise_mutation_model dbr:Vole dbr:Neonatal_diabetes dbr:Euglossa_dilemma dbr:IC_codes dbr:Pyura_doppelgangera dbr:Species_reintroduction dbr:Seafood_mislabelling dbr:Snpstr dbr:European_jackal dbr:Ex_situ_conservation dbr:Fixed_allele dbr:Nucleic_acid_structure dbr:National_Forensic_DNA_Database_of_South_Africa dbr:Polistes_annularis dbr:Molecular-weight_size_marker dbr:Morris_Soller dbr:STR_multiplex_system dbr:Sex_chromosome dbr:Trinucleotide_repeat_disorder dbr:Micro-satellite_analysis dbr:Microsatellite_analysis dbr:Non-coding_DNA dbr:Sugarbird dbr:Vateria_indica dbr:Small_satellite dbr:Rathayibacter_toxicus dbr:Short_Tandem_Repeat dbr:Simple_sequence_repeat dbr:Micro-satellite dbr:Microsatellite_(genetics) dbr:Microsatellite_DNA dbr:Microsatellite_repeats dbr:Nucleic_acid_repetitive_sequence dbr:Simple_Sequence_Repeats dbr:Simple_sequence_repeats dbr:Single_tandem_repeat dbr:Single_tandem_repeats dbr:Inter-simple_sequence_repeat dbr:Short_Tandem_Repeats dbr:Short_tandem_repeat_polymorphism dbr:Short_tandem_repeats dbr:CA_repeat |
| is dbp:spacecraftType of | dbr:Orbiting_Binary_Black_Hole_Investigation_Satellite |
| is gold:hypernym of | dbr:VesselSat-2 dbr:MIMOSA dbr:Sloshsat-FLEVO dbr:CHIPSat dbr:ANUSAT dbr:EduSAT dbr:Reflector_(microsatellite) dbr:TET-1 dbr:Diwata-1 dbr:Near_Earth_Object_Surveillance_Satellite dbr:X-Sat dbr:TiungSAT-1 |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Microsatellite |
