Interactome (original) (raw)
Als Interaktom [ɪntɐʔakˈtoːm, ɪntərakˈtoːm] wird das Gesamtnetzwerk der molekularen Wechselwirkungen in der Zelle bezeichnet. Oft wird der Begriff auf die Wechselwirkungen zwischen Proteinen eingeschränkt. Die noch junge biologische Disziplin der Erforschung von Interaktomen heißt Interaktomik (Interactomics). Die Größe des Interaktoms wurde ferner als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | التآثروم (بالإنجليزية: Interactome) في علم الأحياء الجزيئي هو جميع التآثرات في خلية معينة، ويشير المصطلح بشكل خاص إلى التآثرات الفيزيائية بين الجزيئات (مثل التآثرات بين البروتينات والتي تعرف بتآثرات البروتين-بروتين، أو بين جزيئات صغيرة والبروتينات) لكن يمكن أن يشمل كذلك مجموعة التآثرات غير المباشرة بين الجينات. التآثرومات المبنية على تآثرات البروتين بروتين يجب أن تُلحَق ببروتيوم الأجناس ذات الصلة بها وذلك في سبيل توفير منظر عام ("أوميكس") لجميع التآثرات الجزيئية الممكنة التي يمكن للبروتين القيام بها. تمت صياغة المصطلح «إنتراكتوم» سنة 1999 بواسطة مجموعة من العلماء الفرنسيين يقودهم برنارد جاك. رياضيا، يمكن تمثيل التآثرومات ، ورغم إمكانية وصف التآثرومات بأنها شبكات بيولوجية، إلا أنه لا يجب خلطها مع شبكات أخرى مثل الشبكات العصبية أو الشبكات الغذائية. (ar) Als Interaktom [ɪntɐʔakˈtoːm, ɪntərakˈtoːm] wird das Gesamtnetzwerk der molekularen Wechselwirkungen in der Zelle bezeichnet. Oft wird der Begriff auf die Wechselwirkungen zwischen Proteinen eingeschränkt. Die noch junge biologische Disziplin der Erforschung von Interaktomen heißt Interaktomik (Interactomics). Die Größe des Interaktoms wurde ferner als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen. (de) In molecular biology, an interactome is the whole set of molecular interactions in a particular cell. The term specifically refers to physical interactions among molecules (such as those among proteins, also known as protein–protein interactions, PPIs; or between small molecules and proteins) but can also describe sets of indirect interactions among genes (genetic interactions). The word "interactome" was originally coined in 1999 by a group of French scientists headed by Bernard Jacq. Mathematically, interactomes are generally displayed as graphs. Though interactomes may be described as biological networks, they should not be confused with other networks such as neural networks or food webs. (en) In Biologia molecolare, un interattoma è l'insieme complessivo delle interazioni molecolari in una particolare cellula. Il termine, specificatamente fa riferimento alle interazioni fisiche tra molecole (come tra quelle proteine conosciute come interazioni proteine-proteine) ma descrive anche insiemi di interazioni indirette tra geni (interazioni genetiche). Matematicamente gli interattomi sono mostrati in genere come dei grafi. La parola "interattoma" fu coniata in origine nel 1999 da un gruppo di scienziati francesi capeggiati da Bernard Jacq.Sebbene gli interattomi possono essere descritti come reti biologiche non devono essere confuse con altre reti come quelle neurali o la rete alimentare. (it) 상호작용체(Interactome)는 세포 내에서 상호작용하는 모든 분자나 물질들의 총합을 네트워크로 나타내는 것을 말한다. 이것을 연구하는 학문을 상호작용체학이라고 한다. 상호작용체는 현대 생물학의 가장 중요한 문제중의 하나이다. (ko) Interatômica é uma disciplina que surge da intersecção de bioinformática e biologia, que lida com o estudo, tanto das interações entre as Proteínas e as conseqüências dessas interações, como também de outras moléculas dentro da célula. Interatômica, portanto, tem por objetivo comparar tais redes de interações entre e dentro de espécies, a fim de descobrir como as características de tais redes variam, ou são preservadas. Interatômica é um exemplo de biologia de sistemas top-down o que leva a uma sobrecarga, bem como em geral, a visualização de sistemas biológicos ou organismo. Grandes conjuntos de dados de todo o genoma, proteômica, e correlações entre os diferentes moléculas podem ser inferidos. A partir dos dados novas hipóteses são formuladas sobre o feedback entre estas moléculas. Estas hipóteses podem ser testadas por novos experimentos. Em biologia molecular, Interatoma é todo o conjunto de interações moleculares que ocorre em uma determinada célula. O termo refere-se especificamente à interações físicas entre as moléculas (como aquelas entre proteínas, também conhecida como Interação proteína-proteína) mas também pode descrever conjuntos de interações indiretas entre genes (Integração genética), ainda indireta entre proteínas quando elas participam utilizando um substrato ou produto em uma via metabólica. A palavra "interatôma" foi originalmente criado em 1999 por um grupo de cientistas franceses liderado por . Embora interatomas possam ser descritos como redes biológicas, eles não devem ser confundidos com outras redes, como redes neurais ou cadeias alimentares. (pt) Em biologia molecular, interactoma é o conjunto de todas as interações moleculares em determinada célula. O termo refere-se especificamente às interações físicas entre moléculas, embora possa também significar interações indiretas entre genes. Os interactomas são geralmente representados através de grafos. (pt) Интеракто́м (англ. Interactome) — термин молекулярной биологии, обозначающий полный набор взаимодействий между молекулами в отдельной клетке. Интерактом включает как непосредственные физические контакты между белками (белок-белковые взаимодействия), так и непрямые взаимодействия генов (например, эпистаз). Слово «интерактом» было изначально придумано в 1999 году группой французских ученых во главе с Бернаром Жаком. С математической точки зрения, интерактомы чаще всего представляются как графы. Интеракто́мика (англ. Interactomics) — дисциплина, которая занимается изучением взаимодействий и последствий этих взаимодействий между белками и другими молекулами внутри клетки. Таким образом, целью интерактомики является сравнение сетей взаимодействий (то есть интерактомов) у различных видов или внутри одного вида, для того чтобы узнать, какие черты таких сетей сохранились или изменились. Интерактомику можно рассматривать как пример подхода «сверху вниз» в системной биологии, который позволяет взглянуть на организм или биосистему в целом. Специалистами в области интерактомики собраны большие наборы полногеномных и протеомных данных и определены корреляции между молекулами. Из этой информации формулируются новые гипотезы об ответных реакциях этих молекул, которые могут быть проверены в новых экспериментах. (ru) Інтерактом (від англ. interactome, за аналогією із словом «геном») — повний набір молекулярних взаємодій в клітині або тканині. Зазвичай інтерактом зображається у вигляді орієнтованого графу. Коли мова йде виключно про протеоміку, інтерактом означає мережі білок-білкових взаємодій або білкові мережі. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Network_of_how_100_of...nd_its_core_interactors.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://www.ebi.ac.uk/intact http://biosual.cbio.uct.ac.za/pinv.html http://www.thebiogrid.org/ http://interactome.org http://mentha.uniroma2.it https://web.archive.org/web/20111004173202/http:/protinfo.compbio.washington.edu/ppc/ https://zenodo.org/record/924817 http://gpsprot.org |
| dbo:wikiPageID | 1075046 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 61665 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1123225901 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Caenorhabditis_elegans dbr:Power_law dbr:Prokaryotes dbr:Mutation dbr:Neural_network dbr:Mesorhizobium_loti dbr:Metabolic_network dbr:Metabolic_network_modelling dbr:Biology dbr:Homo_sapiens dbr:Betweenness_centrality dbr:Cytomegalovirus dbr:Varicella_zoster_virus dbr:Degree_(graph_theory) dbr:Mass_spectrometry dbr:Saccharomyces_cerevisiae dbr:List_of_omics_topics_in_biology dbr:Protein–protein_interaction dbr:Proteomics dbc:Bioinformatics dbr:Mathematical_biology dbr:Membrane_proteins dbr:SARS-CoV-2 dbr:Chemoproteomics dbr:Genome dbr:Scale-free_network dbr:Interaction_network dbr:Enzymes dbr:Epistasis_and_functional_genomics dbr:Genomics dbr:Glossary_of_graph_theory dbr:Graph_(discrete_mathematics) dbr:Mutations dbr:Connectome dbr:Arabidopsis_thaliana dbr:Maize dbr:Staphylococcus_aureus dbr:Clustering_coefficient dbr:Metabolic_pathway dbr:Schizosaccharomyces_pombe dbr:Omics dbr:Cell_(biology) dbr:Topology dbr:Drosophila_melanogaster dbc:Molecular_biology dbc:Protein_complexes dbr:Escherichia_coli dbr:Eukaryotes dbr:Food_web dbr:Brassica_rapa dbr:Disease dbr:Graph_theory dbr:Epstein-Barr_virus dbr:Kaposi's_sarcoma-associated_herpesvirus dbr:Protein dbr:Helicobacter_pylori dbr:Bacillus_licheniformis dbr:Hypothetical_protein dbr:Streptococcus_pneumoniae dbr:Solanum_lycopersicum dbr:Lambda_phage dbr:BioPlex dbr:Bioinformatics dbr:Biological_network dbr:Biomarker dbr:Synechocystis dbr:Systems_biology dbr:T7_phage dbr:Hepatitis_C_virus dbr:Hepatitis_E_virus dbr:Translation_(biology) dbc:Systems_biology dbr:Populus_trichocarpa dbr:Human_interactome dbr:Oryza_sativa dbr:Campylobacter_jejuni dbr:Mycoplasma_genitalium dbr:Network_medicine dbr:Log-log_plot dbr:IBIS_(server) dbr:Chandipura_virus dbr:Mycobacterium_tuberculosis dbr:Molecular_biology dbr:Two-hybrid_screening dbr:Xanthomonas_oryzae dbr:Treponema_pallidum dbr:Affinity_purification dbr:Bacterial_two-hybrid_screen dbr:Yeast_two-hybrid dbr:Drug_target dbr:Protein–protein_interactions dbr:Social_networks dbr:Signaling_pathway dbr:Random_Forest dbr:Random_genetic_drift dbr:Herpes_simplex_virus_1 dbr:Genetic_interactions dbr:Budding_yeast dbr:Y2H dbr:File:Figure1_interactome_highres.tif dbr:File:Network_of_how_100_of_the_528_gen...to_DISC1_and_its_core_interactors.png dbr:File:Schziophrenia_PPI.jpg dbr:File:Yeast_interactome_size_estimate.png dbr:File:The_protein_interaction_network_of_Treponema_pallidum.png |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:Main dbt:Original_research dbt:Reflist |
| dcterms:subject | dbc:Bioinformatics dbc:Molecular_biology dbc:Protein_complexes dbc:Systems_biology |
| gold:hypernym | dbr:Set |
| rdfs:comment | Als Interaktom [ɪntɐʔakˈtoːm, ɪntərakˈtoːm] wird das Gesamtnetzwerk der molekularen Wechselwirkungen in der Zelle bezeichnet. Oft wird der Begriff auf die Wechselwirkungen zwischen Proteinen eingeschränkt. Die noch junge biologische Disziplin der Erforschung von Interaktomen heißt Interaktomik (Interactomics). Die Größe des Interaktoms wurde ferner als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen. (de) 상호작용체(Interactome)는 세포 내에서 상호작용하는 모든 분자나 물질들의 총합을 네트워크로 나타내는 것을 말한다. 이것을 연구하는 학문을 상호작용체학이라고 한다. 상호작용체는 현대 생물학의 가장 중요한 문제중의 하나이다. (ko) Em biologia molecular, interactoma é o conjunto de todas as interações moleculares em determinada célula. O termo refere-se especificamente às interações físicas entre moléculas, embora possa também significar interações indiretas entre genes. Os interactomas são geralmente representados através de grafos. (pt) Інтерактом (від англ. interactome, за аналогією із словом «геном») — повний набір молекулярних взаємодій в клітині або тканині. Зазвичай інтерактом зображається у вигляді орієнтованого графу. Коли мова йде виключно про протеоміку, інтерактом означає мережі білок-білкових взаємодій або білкові мережі. (uk) التآثروم (بالإنجليزية: Interactome) في علم الأحياء الجزيئي هو جميع التآثرات في خلية معينة، ويشير المصطلح بشكل خاص إلى التآثرات الفيزيائية بين الجزيئات (مثل التآثرات بين البروتينات والتي تعرف بتآثرات البروتين-بروتين، أو بين جزيئات صغيرة والبروتينات) لكن يمكن أن يشمل كذلك مجموعة التآثرات غير المباشرة بين الجينات. التآثرومات المبنية على تآثرات البروتين بروتين يجب أن تُلحَق ببروتيوم الأجناس ذات الصلة بها وذلك في سبيل توفير منظر عام ("أوميكس") لجميع التآثرات الجزيئية الممكنة التي يمكن للبروتين القيام بها. (ar) In molecular biology, an interactome is the whole set of molecular interactions in a particular cell. The term specifically refers to physical interactions among molecules (such as those among proteins, also known as protein–protein interactions, PPIs; or between small molecules and proteins) but can also describe sets of indirect interactions among genes (genetic interactions). (en) In Biologia molecolare, un interattoma è l'insieme complessivo delle interazioni molecolari in una particolare cellula. Il termine, specificatamente fa riferimento alle interazioni fisiche tra molecole (come tra quelle proteine conosciute come interazioni proteine-proteine) ma descrive anche insiemi di interazioni indirette tra geni (interazioni genetiche). Matematicamente gli interattomi sono mostrati in genere come dei grafi. (it) Interatômica é uma disciplina que surge da intersecção de bioinformática e biologia, que lida com o estudo, tanto das interações entre as Proteínas e as conseqüências dessas interações, como também de outras moléculas dentro da célula. Interatômica, portanto, tem por objetivo comparar tais redes de interações entre e dentro de espécies, a fim de descobrir como as características de tais redes variam, ou são preservadas. (pt) Интеракто́м (англ. Interactome) — термин молекулярной биологии, обозначающий полный набор взаимодействий между молекулами в отдельной клетке. Интерактом включает как непосредственные физические контакты между белками (белок-белковые взаимодействия), так и непрямые взаимодействия генов (например, эпистаз). Слово «интерактом» было изначально придумано в 1999 году группой французских ученых во главе с Бернаром Жаком. С математической точки зрения, интерактомы чаще всего представляются как графы. (ru) |
| rdfs:label | تآثروم (ar) Interaktom (de) Interattoma (it) Interactome (en) 상호작용체 (ko) Interatômica (pt) Interactoma (pt) Интерактом (ru) Інтерактом (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Interactome wikidata:Interactome wikidata:Interactome dbpedia-ar:Interactome dbpedia-de:Interactome dbpedia-fa:Interactome dbpedia-it:Interactome dbpedia-ko:Interactome dbpedia-pt:Interactome dbpedia-pt:Interactome dbpedia-ru:Interactome dbpedia-uk:Interactome https://global.dbpedia.org/id/4zSA1 |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Interactome?oldid=1123225901&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Network_of_how_100_of...to_DISC1_and_its_core_interactors.png wiki-commons:Special:FilePath/Schziophrenia_PPI.jpg wiki-commons:Special:FilePath/Yeast_interactome_size_estimate.png wiki-commons:Special:FilePath/The_protein_interaction_network_of_Treponema_pallidum.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Interactome |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Interaction_network dbr:Date_hub dbr:Hypothome dbr:Interactomics dbr:Party_hub dbr:Interactomes dbr:Molecular_interaction dbr:Molecular_interaction_network |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Environmental_factor dbr:Epistasis dbr:Short_linear_motif dbr:ERIBA dbr:Interferometry dbr:Liang_Tong dbr:List_of_omics_topics_in_biology dbr:Protein–protein_interaction dbr:Protein–protein_interaction_prediction dbr:Proteome dbr:Proteomics dbr:Proximity_labeling dbr:Chemoproteomics dbr:Nurcan_Tunçbağ dbr:Interaction_network dbr:Connectome dbr:Copurification dbr:Orthohepevirus_A dbr:Host–pathogen_interaction dbr:Pathway_analysis dbr:Macromolecular_docking dbr:Morphome dbr:Cultured_meat dbr:DNA_sequencing dbr:Escherichia_coli dbr:FGED_Society dbr:Grating-coupled_interferometry dbr:Protein dbr:BioPlex dbr:Bioinformatics dbr:Biological_network dbr:Systems_biology dbr:Mitointeractome dbr:C7orf26 dbr:Class_III_β-tubulin dbr:Human_epigenome dbr:Human_interactome dbr:Date_hub dbr:Network_science dbr:ChIA-PET dbr:WormBase dbr:Marc_Wilkins_(geneticist) dbr:Network_medicine dbr:Molecular_pathological_epidemiology dbr:Single-pass_membrane_protein dbr:Systems_Biology_Graphical_Notation dbr:Personalized_medicine dbr:Researchsome dbr:Hypothome dbr:Interactomics dbr:Party_hub dbr:Interactomes dbr:Molecular_interaction dbr:Molecular_interaction_network |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Interactome |
