PDZ domain (original) (raw)
El dominio PDZ es un dominio estructural común de 80-90 aminoácidos que se encuentra en proteínas de señalización en bacterias, levaduras, plantas, virus y animales. PDZ es un acrónimo que combina las primeras letras de tres proteínas - proteína de densidad postsináptica (PSD95), una supresora de tumores en Drosophila (DlgA), y la proteína zonula occludens-1 (zo-1) - que fueron en las primeras en las cuales se descubrió el dominio. También se hace referencia a estos dominios como DHR (región homóloga Dlg) o GLGF, dominios de (glicina-leucina-glicina-fenilalanina). Estos dominios ayudan a anclar proteínas transmembrana al citoesqueleto y mantener unidos los complejos de señalización.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Eine PDZ-Domäne ist ein Teil eines Proteins, welcher mit anderen Proteinen interagieren kann. Es handelt sich um eine modular aufgebaute Proteininteraktionsdomäne, die sequenzspezifisch an kurze Peptide innerhalb anderer Proteine bindet. Solche spezifischen Bindestellen nennt man PDZ-Bindemotiv. Diese Bindestellen liegen oftmals am C-terminalen Ende eines Proteins, können sich aber auch innerhalb eines Proteins befinden, beispielsweise in anderen PDZ-Domänen. Durch PDZ-Domänen gebildete Proteinkomplexe sind an der Signalübertragung von Zellen bis hin zum Aufbau und Erhalt von Zellpolarität beteiligt. (de) El dominio PDZ es un dominio estructural común de 80-90 aminoácidos que se encuentra en proteínas de señalización en bacterias, levaduras, plantas, virus y animales. PDZ es un acrónimo que combina las primeras letras de tres proteínas - proteína de densidad postsináptica (PSD95), una supresora de tumores en Drosophila (DlgA), y la proteína zonula occludens-1 (zo-1) - que fueron en las primeras en las cuales se descubrió el dominio. También se hace referencia a estos dominios como DHR (región homóloga Dlg) o GLGF, dominios de (glicina-leucina-glicina-fenilalanina). Estos dominios ayudan a anclar proteínas transmembrana al citoesqueleto y mantener unidos los complejos de señalización. (es) The PDZ domain is a common structural domain of 80-90 amino-acids found in the signaling proteins of bacteria, yeast, plants, viruses and animals. Proteins containing PDZ domains play a key role in anchoring receptor proteins in the membrane to cytoskeletal components. Proteins with these domains help hold together and organize signaling complexes at cellular membranes. These domains play a key role in the formation and function of signal transduction complexes. PDZ domains also play a highly significant role in the anchoring of cell surface receptors (such as Cftr and FZD7) to the actin cytoskeleton via mediators like NHERF and ezrin. PDZ is an initialism combining the first letters of the first three proteins discovered to share the domain — post synaptic density protein (PSD95), Drosophila disc large tumor suppressor (Dlg1), and zonula occludens-1 protein (zo-1). PDZ domains have previously been referred to as DHR (Dlg homologous region) or GLGF (glycine-leucine-glycine-phenylalanine) domains. In general PDZ domains bind to a short region of the C-terminus of other specific proteins. These short regions bind to the PDZ domain by beta sheet augmentation. This means that the beta sheet in the PDZ domain is extended by the addition of a further beta strand from the tail of the binding partner protein. The C-terminal carboxylate group is bound by a nest (protein structural motif) in the PDZ domain. (en) PDZドメイン（英: PDZ domain）は、細菌、酵母、植物、動物、ウイルスのシグナル伝達タンパク質に存在する、80–90アミノ酸からなる構造ドメインである。PDZドメインを持つタンパク質は、膜中の受容体タンパク質を細胞骨格の構成要素へ固定する際に重要な役割を果たしている。こうしたドメインを持つタンパク質はシグナル伝達複合体の細胞膜での保持と組織化を補助しており、このドメインはシグナル伝達複合体の形成と機能に重要な役割を果たしている。PDZドメインは細胞表面受容体（CFTRやなど）を、やエズリンなどの因子を介してアクチン骨格へ固定する際に極めて重要な役割を果たしている。 「PDZ」は、このドメインを持つことが最初に発見された3つのタンパク質、、、の頭文字を組み合わせたものである。PDZドメインは以前にはDHR（Dlg homologous region）ドメインやGLGF（glycine-leucine-glycine-phenylalanine）ドメインといった名称でも呼ばれていた。 一般的に、PDZドメインは特異的タンパク質のC末端の短い領域に結合する。こうした短い領域はPDZドメインに対してβ-sheet augmentation機構によって結合する。すなわち、PDZドメインのβシートに結合パートナータンパク質のテール由来のβストランドが付加されてβシート領域が広がることで結合は行われる。C末端のカルボキシル基にはPDZドメインのnestが結合する。 (ja) Um domínio PDZ é um domínio estrutural, com cerca de 80-90 aminoácidos, encontrado em proteínas sinalizadoras de bactérias, leveduras, plantas e animais. PDZ é um acrónimo que combina as primeiras letras de três proteínas (PSD95, DlgA e zo-1) em que foi descoberto primeiramente que partilhavam este domínio. Os domínios PDZ também podem ser chamados de domínios DHR (do inglês Dlg homologous region) ou GLGF (de glicina-leucina-glicina-fenilalanina). Estes domínios ajudam na ancoragem de proteínas transmembranares ao citosqueleto e a organizar complexos de sinalização. Existem cerca de 260 domínios PDZ em humanos. (pt) |
| dbo:symbol | PDZ |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/PDZ_domain_2DC2.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | https://www.pdznet.eu http://scivee.tv/node/3692 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi%3Fuid=cd00136 |
| dbo:wikiPageID | 5109936 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 34308 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1110898444 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:California_Institute_of_Technology dbr:Proteins dbr:Endocytosis dbr:Enzyme_inhibitor dbr:Ephrin_receptor dbr:Ezrin dbr:HTRA1 dbr:Metabotropic_glutamate_receptor dbr:Metabotropic_glutamate_receptor_5 dbr:Monomer dbr:PTPN13 dbr:SNTA1 dbr:Allosteric_regulation dbr:Hydrogen_bond dbr:Beta-2_adrenergic_receptor dbr:Beta_sheet dbr:Cytoskeleton dbr:DFNB31 dbr:DLG2 dbr:DLG4 dbr:CARD10 dbr:CARD14 dbr:Interleukin_16 dbr:Neurotransmitter dbr:Ligand_(biochemistry) dbr:GIPC1 dbr:GIPC2 dbr:GIPC3 dbr:GOPC dbr:GRIP1_(gene) dbr:GRIP2 dbr:Shaker_gene dbr:Protein–protein_interaction dbr:SDCBP2 dbr:Sodium-hydrogen_antiporter_3_regulator_1 dbr:LIMK2 dbr:LIN7B dbr:LIN7C dbr:LMO7 dbr:LNX1 dbr:PDZK1 dbr:PARD6B dbr:Chemical_synapse dbr:Nest_(protein_structural_motif) dbr:Neuron dbr:LIMK1 dbr:Vestibular_system dbr:PARD6A dbr:SCRIB dbr:PPP1R9A dbr:Enzyme dbr:Glycine dbr:Muscle_spindle dbr:Erbin_(protein) dbr:LRRC7 dbr:Animal dbr:Apoptosis dbr:Archaea dbr:Leucine dbr:Fraser_syndrome dbr:Hair_cell dbr:PRX_(gene) dbr:Post-translational_modification dbr:Substrate_(biochemistry) dbr:Mechanosensation dbr:Bacteria dbc:Membrane_proteins dbr:Actin dbr:Action_potential dbr:Active_site dbr:Cyclic_nucleotide-gated_ion_channel dbr:HOMER1 dbr:DLG1 dbr:DLG3 dbr:DLG5 dbr:DVL1 dbr:DVL2 dbr:DVL3 dbr:Ionic_bonding dbr:Long-term_potentiation dbr:RHPN1 dbr:Alkaline_phosphatase dbr:Alpha_helix dbr:Amino_acid dbr:Cysteine dbr:Eukaryote dbr:FZD7 dbr:File:ExamplePDZproteins.jpg dbr:Nitric_oxide dbr:Nitric_oxide_synthase dbr:Cell_death dbr:Cell_growth dbr:Cell_junction dbr:Dimer_(chemistry) dbr:Glutamate_receptor-interacting_protein dbr:Protein_domain dbr:Receptor_(biochemistry) dbr:Receptor_tyrosine_kinase dbr:Redox dbc:Protein_domains dbr:AHNAK dbr:AHNAK2 dbr:APBA1 dbr:APBA2 dbr:APBA3 dbr:ARHGEF11 dbr:ARHGEF12 dbr:Hydrophobe dbr:Mary_B._Kennedy dbr:SYNJ2BP dbr:PICK1 dbr:PDLIM4 dbr:AMPA_receptor dbr:Cftr dbr:Biomolecular_structure dbr:Homology_(biology) dbr:Signal_transduction dbr:Yeast dbr:SIPA1L2 dbr:RIMS1 dbr:Disulfide dbr:Dominance_(genetics) dbr:Auditory_system dbr:C-terminus dbr:CARD11 dbr:CASK dbr:Phenylalanine dbr:Plants dbr:HTRA2 dbr:INADL dbr:Initialism dbr:CNKSR2 dbr:CNKSR3 dbr:CRIPT dbr:MAGI1 dbr:MAGI2 dbr:MAGI3 dbr:MAST1 dbr:MAST2 dbr:SHANK1 dbr:SHANK2 dbr:SHANK3 dbr:Virus dbr:PSCDBP dbr:Tax1 dbr:MPP1 dbr:SDCBP dbr:MLLT4 dbr:FRMPD3 dbr:FRMPD4 dbr:Cell_surface_receptors dbr:Lysosome dbr:PDLIM3 dbr:RGS3 dbr:PPP1R9B dbr:SNTG1 dbr:Tight_junction_protein_1 dbr:PTPN3 dbr:RGS12 dbr:RIMS2 dbr:SNX27 dbr:N-terminus dbr:NMDA_receptor dbr:LDB3 dbr:PDZD11 dbr:PTPN4 dbr:MPDZ dbr:MPP6 dbr:NOS1 dbr:Oncogene dbr:SHROOM3 dbr:TJP3 dbr:Two-hybrid_screening dbr:Phosphorylation dbr:MAGIX dbr:RAPGEF2 dbr:PDLIM7 dbr:LIN7A dbr:SIPA1L1 dbr:Syntrophin,_alpha_1 dbr:SNTB2 dbr:USH1C dbr:PDLIM5 dbr:PDLIM1 dbr:TAX1BP3 dbr:SNTB1 dbr:TRPC5 dbr:PDZD4 dbr:SNTG2 dbr:SYNPO2 dbr:PDZRN3 dbr:MPP5 dbr:SCN5A dbr:TRPC4 dbr:MYO18A dbr:PARD3 dbr:PDZD2 dbr:PDLIM2 dbr:Eubacteria dbr:SIPA1 dbr:Lipid_membrane dbr:SAP97 dbr:SHROOM2 dbr:SLC9A3R1 dbr:SLC9A3R2 dbr:AIP1 dbr:NHERF dbr:ERBB2IP dbr:WHRN dbr:Structural_domain dbr:TIAM1 dbr:TJP1 dbr:TJP2 dbr:AAG12 dbr:CLP-36 dbr:DVL1L1 dbr:FRMPD2L1 dbr:File:DisulfidbruckeV2.svg dbr:File:PDB_1r6j_EBI.jpg dbr:File:PDZ_figure_1.png dbr:File:PSD95PDZscaffolding.png dbr:KIAA1849 dbr:MCSP_(protein) dbr:PDZD5A dbr:RIL_(gene) dbr:SPAL2 dbr:PDZD8 dbr:CRTAM dbr:HTRA3 dbr:HTRA4 dbr:SHROOM4 dbr:SIPA1L3 dbr:STXBP4 dbr:SYNPO2L dbr:TIAM2 dbr:ARHGAP21 dbr:ARHGAP23 dbr:FRMPD1 dbr:FRMPD2 dbr:LNX2 dbr:MAST3 dbr:MAST4 dbr:MPP3 dbr:MPP4 dbr:MPP7 dbr:PARD6G dbr:PDZD3 dbr:PDZD7 dbr:PDZRN4 dbr:GRASP_(gene) |
| dbp:caption | Molecular structure of the PDZ domain included in the human GOPC protein (en) |
| dbp:cdd | cd00136 (en) |
| dbp:interpro | IPR001478 (en) |
| dbp:pdb | B:248-262 A:388-442 A:151-232 A:151-232 A:151-232 A:151-232 A:426-492 A:639-680 A:14-91 A:14-91 A:663-754 A:663-754 A:778-859 A:1147-1226 A:920-1007 A:517-602 A:81-161 A:81-161 A:81-161 A:81-161 :466-544 A:313-391 A:313-391 A:313-391 A:313-391 A:313-391 A:386-464 A:65-149 A:65-149 A:65-149 A:224-308 A:160-244 A:193-277 A:226-310 A:47-125 A:871-947 A: 728-812 A:993-1073 A:974-1056 A:504-589 A:1357-1439 A:1357-1439 A:1357-1439 A:1368-1450 A:1368-1450 A:1368-1450 A:1100-1189 A:22-94 A:254-339 A:251-336 A:1323-1407 A:1323-1407 A:1323-1407 A:140-219 A:279-357 A:211-289 A:17-103 A:249-336 A:1240-1316 A:412-495 A:10-94 A:988-1067 A:605-688 A:619-702 A:668-753 A:816-887 A:17-96 A:17-96 A:656-740 A:656-740 A:656-740 A:656-740 A:471-557 A:471-557 A:456-542 A:248-329 A:672-751 A:672-751 A:5-82 A:4-81 A:3-81 :533-616 A:752-838 B:300-373 A:18-92 A:114-191 B:114-191 B:114-191 A:114-191 A:419-501 A:256-333 A:490-568 D:157-247 A:160-250 B:198-270 A:198-270 A:198-270 A:198-270 A:747-820 A:747-820 (en) |
| dbp:pfam | PF00595 (en) |
| dbp:prosite | PDOC50106 (en) |
| dbp:scop | 1 (xsd:integer) |
| dbp:smart | PDZ (en) |
| dbp:symbol | PDZ (en) |
| dbp:width | 200 (xsd:integer) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:ELM dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:PDB3 dbt:Protein_domains dbt:Pfam_box |
| dcterms:subject | dbc:Membrane_proteins dbc:Protein_domains |
| gold:hypernym | dbr:Domain |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 yago:WikicatMembraneProteins yago:Abstraction100002137 yago:Attribute100024264 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Environment113934596 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:Protein yago:Situation113927383 yago:Sphere114514039 yago:State100024720 yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteinDomains |
| rdfs:comment | El dominio PDZ es un dominio estructural común de 80-90 aminoácidos que se encuentra en proteínas de señalización en bacterias, levaduras, plantas, virus y animales. PDZ es un acrónimo que combina las primeras letras de tres proteínas - proteína de densidad postsináptica (PSD95), una supresora de tumores en Drosophila (DlgA), y la proteína zonula occludens-1 (zo-1) - que fueron en las primeras en las cuales se descubrió el dominio. También se hace referencia a estos dominios como DHR (región homóloga Dlg) o GLGF, dominios de (glicina-leucina-glicina-fenilalanina). Estos dominios ayudan a anclar proteínas transmembrana al citoesqueleto y mantener unidos los complejos de señalización. (es) Eine PDZ-Domäne ist ein Teil eines Proteins, welcher mit anderen Proteinen interagieren kann. Es handelt sich um eine modular aufgebaute Proteininteraktionsdomäne, die sequenzspezifisch an kurze Peptide innerhalb anderer Proteine bindet. Solche spezifischen Bindestellen nennt man PDZ-Bindemotiv. Diese Bindestellen liegen oftmals am C-terminalen Ende eines Proteins, können sich aber auch innerhalb eines Proteins befinden, beispielsweise in anderen PDZ-Domänen. (de) The PDZ domain is a common structural domain of 80-90 amino-acids found in the signaling proteins of bacteria, yeast, plants, viruses and animals. Proteins containing PDZ domains play a key role in anchoring receptor proteins in the membrane to cytoskeletal components. Proteins with these domains help hold together and organize signaling complexes at cellular membranes. These domains play a key role in the formation and function of signal transduction complexes. PDZ domains also play a highly significant role in the anchoring of cell surface receptors (such as Cftr and FZD7) to the actin cytoskeleton via mediators like NHERF and ezrin. (en) PDZドメイン（英: PDZ domain）は、細菌、酵母、植物、動物、ウイルスのシグナル伝達タンパク質に存在する、80–90アミノ酸からなる構造ドメインである。PDZドメインを持つタンパク質は、膜中の受容体タンパク質を細胞骨格の構成要素へ固定する際に重要な役割を果たしている。こうしたドメインを持つタンパク質はシグナル伝達複合体の細胞膜での保持と組織化を補助しており、このドメインはシグナル伝達複合体の形成と機能に重要な役割を果たしている。PDZドメインは細胞表面受容体（CFTRやなど）を、やエズリンなどの因子を介してアクチン骨格へ固定する際に極めて重要な役割を果たしている。 「PDZ」は、このドメインを持つことが最初に発見された3つのタンパク質、、、の頭文字を組み合わせたものである。PDZドメインは以前にはDHR（Dlg homologous region）ドメインやGLGF（glycine-leucine-glycine-phenylalanine）ドメインといった名称でも呼ばれていた。 (ja) Um domínio PDZ é um domínio estrutural, com cerca de 80-90 aminoácidos, encontrado em proteínas sinalizadoras de bactérias, leveduras, plantas e animais. PDZ é um acrónimo que combina as primeiras letras de três proteínas (PSD95, DlgA e zo-1) em que foi descoberto primeiramente que partilhavam este domínio. Os domínios PDZ também podem ser chamados de domínios DHR (do inglês Dlg homologous region) ou GLGF (de glicina-leucina-glicina-fenilalanina). Estes domínios ajudam na ancoragem de proteínas transmembranares ao citosqueleto e a organizar complexos de sinalização. (pt) |
| rdfs:label | PDZ-Domäne (de) Dominio PDZ (es) PDZドメイン (ja) PDZ domain (en) Domínio PDZ (pt) |
| owl:sameAs | freebase:PDZ domain yago-res:PDZ domain wikidata:PDZ domain dbpedia-de:PDZ domain dbpedia-es:PDZ domain dbpedia-ja:PDZ domain dbpedia-pt:PDZ domain dbpedia-sh:PDZ domain dbpedia-sr:PDZ domain https://global.dbpedia.org/id/2KX8Y |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:PDZ_domain?oldid=1110898444&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/DisulfidbruckeV2.svg wiki-commons:Special:FilePath/ExamplePDZproteins.jpg wiki-commons:Special:FilePath/PDB_1r6j_EBI.jpg wiki-commons:Special:FilePath/PDZ_domain_2DC2.png wiki-commons:Special:FilePath/PDZ_figure_1.png wiki-commons:Special:FilePath/PSD95PDZscaffolding.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:PDZ_domain |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:PDZ |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Pdz_domain dbr:Dlg_homologous_region dbr:PDZ_(biology) dbr:PDZ_protein dbr:GLGF |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Ephrin dbr:Ephrin_receptor dbr:Short_linear_motif dbr:HTRA1 dbr:Membrane-associated_guanylate_kinase dbr:PTPN13 dbr:Allograft_inflammatory_factor_1 dbr:DLG4 dbr:Usher_syndrome dbr:CCDC88C_(gene) dbr:David_S._Bredt dbr:ERBB4 dbr:Kv1.1 dbr:GIPC1 dbr:GIPC3 dbr:GRASP65 dbr:Protein–protein_interaction dbr:LMO7 dbr:Pdz_domain dbr:Coronavirus_envelope_protein dbr:Nest_(protein_structural_motif) dbr:LIMK1 dbr:Plexin dbr:SCRIB dbr:Erbin_(protein) dbr:LRRC7 dbr:Cadherin–catenin_complex_in_learning_and_memory dbr:Claudin dbr:Frizzled-1 dbr:PDZ dbr:Parkin_(protein) dbr:Magnetotactic_bacteria dbr:Adenomatous_polyposis_coli dbr:Drosophila_melanogaster dbr:DEPTOR dbr:DLG1 dbr:Junctional_adhesion_molecule dbr:Angiomotin dbr:Nitric_oxide_synthase dbr:Diacylglycerol_kinase dbr:Formins dbr:Glutamate_receptor-interacting_protein dbr:Ephrin_B3 dbr:Dlg_homologous_region dbr:Regulator_of_G_protein_signaling dbr:APBA2 dbr:ARHGEF7 dbr:Target_selection dbr:Coxsackievirus_and_adenovirus_receptor dbr:T-cell_lymphoma_invasion_and_metastasis-inducing_protein_1 dbr:WWTR1 dbr:ABCA1 dbr:AMPA_receptor dbr:Tropic_cues_involved_in_growth_cone_guidance dbr:Citron_kinase dbr:Tight_junction_proteins dbr:Catenin_beta-1 dbr:CNKSR2 dbr:MAGI2 dbr:Statistical_coupling_analysis dbr:SHANK2 dbr:SHANK3 dbr:Wnt_signaling_pathway dbr:InaD-like_protein dbr:Neurexin dbr:Tax1 dbr:FAT1 dbr:ISLR dbr:PDLIM3 dbr:SNTG1 dbr:NOS1AP dbr:LDB3 dbr:TMEM267 dbr:Synaptic_stabilization dbr:MPDZ dbr:SHROOM3 dbr:Syntrophin,_alpha_1 dbr:Peripheral_membrane_protein dbr:USH1C dbr:PHLPP dbr:Papillomaviridae dbr:TAX1BP3 dbr:SNX8 dbr:PDZD2 dbr:YAP1 dbr:Syntrophin dbr:PDZ_(biology) dbr:PDZ_protein dbr:GLGF |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:PDZ_domain |
