Serpin (original) (raw)
Serpin atau Serine Protease Inhibitor adalah sebuah kelompok besar protein yang bekerja sebagai penghambat protease dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak ditemui pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada binatang, tumbuhan, dan bakteri. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target.
.png?width=300)
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | السربين هي مجموعة من البروتينات ذات الهياكل المتماثلة والتي تم تحديدها أولا أنها مجموعة من البروتينات القادرة على تثبيط البروتياز (البيتيداز)، وقد اُبتكرت ترخيمة السربين لأن العديد من السربينات تثبط الكيموتربسين (أنزيم بيتيدي بنكرياسي) مثل سيرين البورتياز (مثبطات سيرين البورتياز). كانت أول أفراد فصيلة السربين تدرس بشكل واسع هي: بروتينات البلازما البشرية أنتي ثرومبين وأنتي تريبسين، واللتان تلعبان دورا رئيسيا في السيطرة على تخثر الدم والالتهابات على التوالي (مثال: الشكل 1). في البداية، ركزت البحوث على دورهما في مرض الإنسان، حيث ينتج عن نقص بروتين أنتي ثرومبين حدوث خثار ويسبب نقص بروتين أنتي تريبسين النفاخ الرئوي. وقدم هانت وديهوف اكتشافا مذهلا في عام 1980 حيث أن كلا من هذه الجزيئات تمتلك سلسلة هامة من الأحماض الأمينية تشابه تلك الموجودة في البروتين الرئيس في بياض بيض الدجاج وفي الزلال، واقترحا فصيلة بروتين جديدة. وتم تحديد أكثر من 1000 سيربين الآن، تتضمن هذه السربينات على 36 بروتينات بشرية، وكذلك الجزيئات الموجودة في النباتات والفطريات والبكتيريا والبَدْئِيَات وبعض الفيروسات. ولذلك فإن السربينات هي أكبر وأكثر عائلة تنوعا لمثبطات البروتياز. في حين أن معظم السربين يتحكم بتحلل البروتين المتسلسل، هناك سربين معين لا يثبط الإنزيمات ولكن يقوم بوظائف متنوعة مثل التخزين (مثل تخزين ألبومين وهو البروتين الأساسي في البيض)، هرمون حامل بروتينات (بروتين القلوبيولين المرتبط بهرمون الثايروكسين أو الكورتيزول والماسبين (ورم الجينات القامع). مصطلح السربين يستخدم ليصف الأجزاء الأخيرة أيضًا على الرغم من عدم تثبيطهم. لأن السربين يتحكم في عمليات كالتجلط والالتهابات، هذه البروتينات هي هدف عمليات البحث الطبي. ومع ذلك، السيربين بحد ذاته محط اهتمام مجتمعات علم الأحياء التركيبي وعلم طي البروتين، لأنها تخضع لتغييرات فريدة ودراماتيكية في الشكل (أو التكوين) عندما يثبط عملية تكسير البروتين بالإنزيمات. وهذه عملية غير اعتيادية، لأن وظيفة معظم مثبطات عمليات تكسير البروتين التقليدية بسيطة كنظرية «المفتاح والقفل» الجزيئات التي ترتبط ووتعيق دخول المناطق النشطة لتكسير البروتين (انظر، على سبيل المثال، مثبط انزيم بوفاين البنكرياسي لبروتين التريبسين). بينما آلية عمل السيربين كمثبط لعملية تكسير البروتين يضفي فوائد معينة، وأيضا لديه سلبيات، والسيربين معرض للطفرات الجينية والتي تكون نتيجة خطأ في عملية طي البروتين وتكوين سلسة طويلة من البلمرات الغير نشطة (سيربينوباثيز). بلمرة السيربين يختزل كمية المثبط النشط، إضافة إلى تراكم أو تكدس في بلمرة السيربين، مسببا موت الخلية أو فشل الأعضاء. على سبيل المثال: السيربين مضاد لبروتين التربسين يتصنع مبدئيا في الكبد، وبلمرة مضاد البروتين تسبب تليف الكبد. فهم سيربينوباثيز، أيضا يزود لمحة أو رؤية للخطأ في طي البروتين عموما، عملية تسبب أمراضا لكثير من الناس، كالزهايمر ومرض كريوتزفيلدت- جاكوب. (ar) Serpine sind Proteine, die in allen Lebewesen vorkommen; beim Menschen machen sie etwa zehn Prozent der Plasmaproteine aus. Sie sind strukturell ähnliche Proteine, welche unterschiedliche Funktionen ausüben können. Die ursprünglich entdeckten Serpine sind in der Lage, die Enzymaktivität von Serinproteinasen zu blockieren (Serpin = Serin-Proteinase-Inhibitoren), diese Eigenschaft besitzen viele andere Serpine jedoch nicht. Zu den Serpinen gehören Antitrypsin, Antithrombin, Ovalbumin, Plasminogen-Aktivator-Inhibitor und . Ihre Aufgabe ist hauptsächlich die Regulation der Protease-Aktivität. Die Proteindatenbank UniProt zählt über 40 gesicherte Mitglieder der Serpin-Familie, über 80 Sequenzen sind bekannt. Strukturell zeichnen sich alle Serpine durch die Anwesenheit von drei β-Faltblättern und neun α-Helices aus, die zusammen eine unter Spannung stehende Struktur bilden. Dies führt dazu, dass jede proteolytische Spaltung an dieser Struktur zum Verlust der Inhibitor-Eigenschaft führt. Inhibitorische Serpine binden an Proteasen in der Nachbarschaft der katalytischen Domäne; der hemmende Effekt ergibt sich zunächst durch sterische Hinderung. Im Weiteren wird das Serpin durch die Protease aufgeschnitten – die freiwerdende Spannung im Serpin führt zu weitreichenden Konformationsänderungen und letztendlich zur Zerstörung der Protease. Die Hemmung ist also irreversibel. Die Bezeichnungen Serpin und Serinprotease-Inhibitor sind nicht synonym, da es außerhalb der Serpine viele andere Hemmer von Serinproteinasen gibt, und Serpine auch andere Proteasen zu hemmen in der Lage sind. Die proteasehemmenden Serpine sind in der MEROPS-Datenbank im Clan 'ID' (Familie 'I4') zusammengefasst und bilden die umfangreichste Klasse von Protease-Inhibitoren. (de) Las serpinas (del inglés, serine protease inhibitors) son una superfamilia de proteínas caracterizadas principalmente por ser , ampliamente distribuida en los seres vivos ya que se pueden encontrar en todos los eucariotas y en algunos procariotas. Si bien la mayoría de las serpinas tienen la función de inhibir serina proteasas, otras inhiben caspasas, y como la papaína. También se encuentran serpinas con otras funciones tales como el transporte de hormonas, chaperonas moleculares o la supresión de tumores. Las serpinas regulan tanto los procesos de formación de coágulos (trombosis) como los de la disolución de ellos (trombolisis), la respuesta inmune, la reparación del tejido conectivo, la apoptosis, el transporte de hormonas, la unión de corticosteroides, la función neuronal y la presión sanguínea. Las serpinas son «inhibidores suicidas» que actúan como carnada para sus serina proteasas objetivos. Este inusual mecanismo de acción consiste en inhibir la proteasa de manera irreversible, puesto que al unirse ambas moléculas son sometidas a un gran cambio conformacional que altera sus quedando inactivas en forma permanente. Consecuentemente estas proteínas son el objetivo de investigación médica, ya que su cambio conformacional único las vuelve de alto interés biológico estructural y de investigación a cerca del doblaje de proteínas. El mecanismo de cambio conformacional contiene ciertas ventajas, pero también algunas desventajas. Por un lado, las serpinas son vulnerables a mutaciones que pueden resultar en serpinopatías como el doblaje erróneo de las proteínas y la formación de polímeros inactivos de cadenas largas. La polimerización de serpinas no solo reduce la cantidad de inhibidores activos sino que también conlleva la acumulación de los polímeros, causando muerte celular y falla de órganos . Aunque la mayoría de las serpinas controlan las cascadas proteolíticas, algunas proteínas con estructura de serpina no son inhibidores de enzimas, pero realizan diversas funciones como almacenamiento (como en el huevo blanco—ovoalbúmina), transporte como en las proteínas de transporte de hormonas (Globulina fijadora de tiroxina, globulina fijadora de cortisol) y de proteína chaperona(HSP47). El término serpina se usa para describir a estos miembro también, a pesar de su función no inhibitoria ya que están relacionados evolutivamente. (es) Les serpines (de l'anglais serpin, mot-valise pour serine protease inhibitor) sont des protéines aux structures semblables, connues historiquement pour leur capacité à inhiber les protéases à sérine. Elles forment une superfamille de protéines présente à travers tous les règnes du vivant. Elles doivent leur nom au fait que les premières à avoir été identifiées inhibent les protéases à sérine de type chymotrypsine. Elles sont remarquables par leur mécanisme d'action, qui consiste à inhiber leur peptidase cible en subissant un changement conformationnel de grande amplitude qui fait disparaître le site actif. Ce mécanisme est très différent du mécanisme compétitif plus courant des inhibiteurs de protéases, qui se lient au site actif de l'enzyme, et empêchent la catalyse d'avoir lieu. L'inhibition des peptidases par les serpines contrôle tout un ensemble de processus biologiques, notamment la coagulation sanguine et l'inflammation, ce qui fait que ces protéines sont l'objet de recherches médicales. Leur changement conformationnel particulier les rend également intéressantes pour les recherches en biologie structurale et en repliement des protéines. Ce mode d'action par changement conformationnel confère des avantages, mais présente aussi quelques inconvénients : les serpines sont ainsi vulnérables aux mutations, qui peuvent conduire à des serpinopathies telles que des serpines au repliement non fonctionnel ou la formation de longs polymères inactifs. La polymérisation de la serpine n'a pas seulement pour effet de réduire la quantité d'inhibiteur actif, mais conduit également à l'accumulation de polymères aux effets nocifs pour la cellule, ce qui aboutit à la mort cellulaire et à celle des organes. Bien que la plupart des serpines contrôlent des cascades protéolytiques, certaines protéines ayant la structure d'une serpine ne sont pas des inhibiteurs enzymatiques mais réalisent diverses fonctions telles que le stockage (comme l'ovalbumine du blanc d'œuf), le transport (comme les transporteurs membranaires d'hormones, tels que la globuline liant la thyroxine et la transcortine), ou encore la fonction de protéine chaperonne ( (en)). Ces protéines-là sont également des serpines, bien qu'elles ne possèdent pas de fonction inhibitrice, car elles sont apparentées du point de vue de l'évolution. (fr) Serpins are a superfamily of proteins with similar structures that were first identified for their protease inhibition activity and are found in all kingdoms of life. The acronym serpin was originally coined because the first serpins to be identified act on chymotrypsin-like serine proteases (serine protease inhibitors). They are notable for their unusual mechanism of action, in which they irreversibly inhibit their target protease by undergoing a large conformational change to disrupt the target's active site. This contrasts with the more common competitive mechanism for protease inhibitors that bind to and block access to the protease active site. Protease inhibition by serpins controls an array of biological processes, including coagulation and inflammation, and consequently these proteins are the target of medical research. Their unique conformational change also makes them of interest to the structural biology and protein folding research communities. The conformational-change mechanism confers certain advantages, but it also has drawbacks: serpins are vulnerable to mutations that can result in serpinopathies such as protein misfolding and the formation of inactive long-chain polymers. Serpin polymerisation not only reduces the amount of active inhibitor, but also leads to accumulation of the polymers, causing cell death and organ failure. Although most serpins control proteolytic cascades, some proteins with a serpin structure are not enzyme inhibitors, but instead perform diverse functions such as storage (as in egg white—ovalbumin), transport as in hormone carriage proteins (thyroxine-binding globulin, cortisol-binding globulin) and molecular chaperoning (HSP47). The term serpin is used to describe these members as well, despite their non-inhibitory function, since they are evolutionarily related. (en) Serpin atau Serine Protease Inhibitor adalah sebuah kelompok besar protein yang bekerja sebagai penghambat protease dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak ditemui pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada binatang, tumbuhan, dan bakteri. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target. (in) セルピン（セリンプロテアーゼインヒビター、セリンプロテアーゼ阻害剤、英: Serpin）は、最初にプロテアーゼ阻害効果を持つ事で同定された類似構造を持つタンパク質のスーパーファミリーで、全ての界の生物で発見される。セルピン (serpin) の略名は元々最初に同定されたセルピンがキモトリプシン様セリンプロテアーゼに対して働く (serine protease inhibitors) ために名付けられた造語である。特筆すべきはセルピンの珍しい活性機構であり、セルピンは立体構造の大きな変化を受ける事でプロテアーゼの活性中心を破壊し、標的を不可逆的に阻害する。この阻害機構は他の一般的なプロテアーゼ阻害剤が競合的阻害剤で、酵素と結合して活性中心を塞ぐ事で働くのと対照的である。 セルピンによるプロテアーゼ阻害は血液凝固反応や炎症といった数々の生化学行程を制御するため、セルピンに含まれるタンパク質は医学研究の対象となる。セルピンの構造変化はユニークであり、それゆえに構造生物学やタンパク質の折りたたみの解析においてもセルピンは興味深い研究対象とされる。構造変化による阻害機構はいくつかの利点を持つが、同時に欠点も抱えており、タンパク質の折りたたみ異常や不活性の長鎖重合体の形成のようなセルピン病 (serpinopathy) を起因する変異に対し脆弱である。セルピンの重合反応は活性を有する阻害剤の減少につながるのみならず、細胞死やをも起こしうる。 ほとんどのセルピンはタンパク質の分解反応を制御するが、中にはセルピンの構造を持ちながら酵素阻害剤として働かず、貯蔵（卵白中のオボアルブミンのように）や、ホルモンの輸送タンパク質（チロキシン結合グロブリンやトランスコルチン）のように運搬に関わったり、分子シャペロン（ヒートショックプロテイン47）として働くものもある。以上のようなタンパク質は阻害剤として働かないにも関わらず、進化学的に近縁なため、セルピンという語句はセリンプロテアーゼの阻害剤以外にも使われる。 (ja) Gli inibitori delle serin proteasi o serpine sono stati il primo gruppo di proteine, aventi struttura simile, a essere identificate come capaci di inibire le serin proteasi. Il nome serpina è un acronimo dell'inglese serine protease inhibitors (inibitori delle proteasi a serina). Le serpine, essendo molto numerose, formano una superfamiglia di proteine. (it) Serpiny – nadrodzina białek o podobnej strukturze, zidentyfikowanych po raz pierwszy dzięki ich aktywności hamowania proteaz. Występują we wszystkich królestwach organizmów żywych. Akronim stanowiący ich nazwę ukuto, ponieważ pierwsze zidentyfikowane serpiny działały jako inhibitory proteaz serynowych przypominających chymotrypsynę (serine protease inhibitors). Znane są z niezwykłego mechanizmu działania, inhibicji nieodwracalnej. Doprowadzają proteazy do znacznej zmiany konformacji, niszcząc miejsce aktywne. Kontrastuje to z bardziej powszechnym mechanizmem inhibicji kompetycyjnej proteaz, w którym inhibitor przyłącza się do miejsca aktywnego enzymu i blokuje je. Hamowanie proteaz przez serpiny kontroluje szereg procesów biologicznych, jak krzepnięcie czy zapalenie, w efekcie czego białka te stanowią przedmiot badań medycznych. Ich unikalna zmiana konformacyjna czyni je także przedmiotem zainteresowania biologii strukturalnej i badań zwijania białek. Mechanizm zmiany konformacyjnej daje pewne zalety, ale również i wady: geny serpin są podatne na mutacje, mogące skutkować serpinopatiami, jak niewłaściwe fałdowanie się białka czy tworzenie się nieaktywnych długołańcuchowych polimerów. Polimeryzacja serpin nie tylko ogranicza ilość dostępnego aktywnego inhibitora, ale również prowadzi do odkładania się polimerów, co skutkuje śmiercią komórki i dysfunkcją narządu. Choć większość serpin kontroluje kaskady proteolityczne, niektóre z białek o budowie serpiny nie są inhibitorami enzymów, pełniąc zamiast tego różne funkcje, jak magazynowanie białka (jak w przypadku białka jaja), transport (jak białka transportujące hormony, np. , ) czy opiekowanie się innymi białkami (jak ). Terminem serpin określa się je wszystkie pomimo odmiennej funkcji, ponieważ wiąże je pokrewieństwo ewolucyjne. (pl) Serpiner är en grupp proteiner med liknande uppbyggnad som blockerar proteaser, dvs enzymer som bryter ned proteiner. Namnet kommer av att de först upptäcka serpinerna blockerar kymotrypsin-liknande serinproteas (därav förkortningen serine protease inhibitors). De första serpinerna som utforskades var de mänskliga plasmaproteinerna antitrombin och antitrypsin, som är nödvändiga för att kontrollera blodkoagulering och inflammationsreaktionen. I början fokuserades forskningen på mänskliga sjukdomar: antitrombinbrist vid trombos och antitrypsinbrist som orsakar emfysem. År 1980 gjorde Hunt och Dayhoff den oväntade upptäckten att båda molekylerna delar viktiga aminosyresekvenser liknande det vanligaste proteinet i äggvita, , och de föreslog då att en ny proteinfamiljbenämning skulle användas. Sedan dess har över 1000 serpiner identifierats, bland annat 36 mänskliga proteiner, men även molekyler i växter, svampar, bakterier, arkéer och vissa poxvirus. Serpiner är därmed den största och mest diversifierade familjen proteasinhibitorer. (sv) As serpinas são uma superfamília de proteínas com estruturas semelhantes que foram identificadas pela inibição da protease e podem ser encontradas em todos os reinos. O acrónimo serpina foi cunhado porque as primeiras serpinas a serem identificadas actuavam como quimotripsina serina-protease (serina protease inibidora). Destacam-se pelo seu inusitado mecanismo de acção, no qual inibem irreversivelmente a sua protease alvo, ao submeterem-se a uma grande para alterar o seu sítio activo. Isto contrasta com o mecanismo mais comum dos inibidores de protease que se ligam e bloqueiam o acesso da protease ao sítio activo. A inibição da protease por serpinas controla a matriz dos processos biológicos, incluindo a coagulação e inflamação. Estas proteínas são, por conseguinte, objecto de , uma vez que a sua troca conformacional única confere-lhe um alto interesse biológico estrutural e de investigação sobre o enovelamento de proteínas O mecanismo de troca conformacional possui algumas vantagens, mas também alguns inconvenientes. Por um lado, as serpinas são vulneráveis a mutações que podem resultar em serpinopatias como o não-enovelamento das proteínas e a formação de polímeros inactivos de cadeias longas. A polimerização de serpinas não só reduz a quantidade de inibidores activos, como também implica a acumulação dos polímeros, causando morte celular e insuficiência dos órgãos. (pt) 丝氨酸蛋白酶抑制剂（英語：serpin；serine protease inhibitors）是具有相似结构蛋白质的蛋白质超家族，它是由于蛋白酶抑制活性被识别的，和在生命的各个界被发现的第一个蛋白质超家族。英文缩写丝氨酸蛋白酶抑制剂（英語：serpin）最初被创造，是因为第一个丝氨酸蛋白酶抑制剂对胰凝乳蛋白酶样丝氨酸蛋白酶（丝氨酸蛋白酶抑制剂）将要被识别的行为。它们值得注意的是其动作的不同寻常的机制，它们不可逆地通过经历大的构象改变，扰乱其活性位点抑制它们的靶蛋白酶。与此相反，通过对于结合并阻止访问蛋白酶活性位点的蛋白酶抑制剂是更常见的机制。 由丝氨酸蛋白酶抑制剂的蛋白酶抑制控制的一系列生物过程，包括凝血和炎症，因此这些蛋白质是医学研究的目标。对于结构生物学和蛋白质折叠研究社区，它们独特的构象变化也使它们成为研究的兴趣。构象变化机制赋予某些优点，但是它也具有缺点：丝氨酸蛋白酶抑制剂易受到突变的影响，所述突变可导致丝氨酸蛋白酶抑制剂病例如蛋白质错误折叠（Proteopathy）和形成无活性的长链聚合物。丝氨酸蛋白酶抑制剂聚合不仅减少活性抑制剂的量，而且导致聚合物的积聚，引起细胞死亡和器官衰竭。 虽然大多数丝氨酸蛋白酶抑制剂控制蛋白酶解级联，但一些具有丝氨酸蛋白酶抑制剂结构的蛋白质并不是酶抑制剂，而是执行多样化的功能，例如（例如蛋白-），运输例如激素载体蛋白（甲状腺素结合球蛋白，）和分子伴侣（）。术语“丝氨酸蛋白酶抑制剂”也被用于描述这些成员，尽管它们具有非抑制功能，因为它们在进化上是相关的。 (zh) Серпины (англ. Serpins, сокращение от англ. serine protease inhibitors, «ингибиторы сериновых протеаз») — группа белков, которые имеют определённое структурное сходство между собой и многие из которых ингибируют сериновые протеазы, то есть протеазы, имеющие серин в активном центре. (ru) |
| dbo:symbol | Serpin, SERPIN (root symbolof family) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/serpin_(stressed).png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://bcmg.com.uic.edu/faculty/gettins_peter.html http://huntingtonlab.cimr.cam.ac.uk/ https://whisstock-lab.med.monash.edu.au/ https://web.archive.org/web/20060504050207/http:/pharm.kuleuven.be/biotech/index.htm https://web.archive.org/web/20161030180728/http:/huntingtonlab.cimr.cam.ac.uk/ https://web.archive.org/web/20161121042631/https:/www.med.unc.edu/pharm/people/joint-faculty/frank-church-1 http://merops.sanger.ac.uk/cgi-bin/famsum%3Ffamily=I4 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi%3Fdb=nuccore&id=47125085 http://sydney.edu.au/agriculture/academic_staff/tom.roberts.php http://www.weizmann.ac.il/plants/fluhr/ https://www.genenames.org/cgi-bin/genefamilies/ |
| dbo:wikiPageID | 564590 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 139822 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1104040210 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Caenorhabditis_elegans dbr:Calpain dbr:Catalytic_triad dbr:Prion dbr:Progesterone dbr:Protein_C dbr:Protein_Z dbr:Proteopathy dbr:Rodent dbr:Endocytosis dbr:Endometrium dbr:Endoplasmic_reticulum dbr:Enzyme_inhibitor dbr:Enzyme_kinetics dbr:Metacaspase dbr:Prokaryote dbr:Prolamin dbr:Biochemistry dbr:Bird dbr:Dementia dbr:Allosteric_regulation dbr:Allotransplantation dbr:Anticoagulant dbr:Antithrombin dbr:Beta_sheet dbr:University_of_Cambridge dbr:University_of_North_Carolina_at_Chapel_Hill dbr:University_of_Sydney dbr:Viruses dbr:Developmental_biology dbr:Induced_pluripotent_stem_cell dbr:Inflammation dbr:Innate_immune_system dbr:Interleukin_18 dbr:LDL_receptor dbr:Protein_aggregation dbr:Viral_protein dbr:University_of_Illinois_at_Chicago dbr:Thyroxine dbr:Competitive_inhibition dbr:Cortisol dbr:Cowpox dbr:Animals dbr:Medical_research dbr:SERPINI1 dbr:Ester dbr:Estrogen dbr:Gene_knockout dbr:Genetic_disorder dbr:Genus dbr:SERPINA4 dbr:Vitronectin dbr:Nucleophile dbr:Proteolysis dbr:Transcortin dbr:Notch_signaling_pathway dbr:Protein_tertiary_structure dbr:Cirrhosis dbr:Clostridium_thermocellum dbr:Emphysema dbr:Enzyme_catalysis dbr:Fungi dbr:Fungus dbr:Monash_University dbr:Multiple_sclerosis dbr:Murine dbr:Mutations dbr:Conceptus dbr:Conformational_change dbr:Thermoanaerobacter dbr:LRP1 dbr:Alpha_1-antitrypsin_deficiency dbr:Structural_biology dbr:Organ_dysfunction dbr:Prolastin dbr:Angioedema dbr:Apoptosis dbr:Arabidopsis_thaliana dbr:Archaea dbr:Alpha_1-antitrypsin dbr:Liver_cirrhosis dbr:Mammal dbr:Substrate_(chemistry) dbr:Horizontal_gene_transfer dbr:Papain-like_protease dbr:Periventricular_nucleus dbr:Plasminogen_activator_inhibitor-1 dbr:Plasminogen_activator_inhibitor-2 dbr:Protease_inhibitor_(biology) dbr:Protein_C_inhibitor dbr:Macular_degeneration dbr:Protein_superfamily dbr:Regional_specification dbr:Thyroxine-binding_globulin dbr:Toll-like_receptor dbr:Maspin dbr:Bacteria dbr:C1-inhibitor dbr:Active_site dbr:Weizmann_Institute_of_Science dbr:Dockerin dbr:Drosophila_melanogaster dbr:Cytotoxic dbr:Hearing_loss dbr:Heat_shock_protein_47 dbr:SERPINI2 dbr:Allosteric dbr:Alpha-1_antitrypsin dbr:Alpha_helix dbr:Cysteine dbr:Cysteine_protease dbr:Drosophila dbr:Dynamic_equilibrium dbr:Alpha-1_antitrypsin_deficiency dbr:Alpha_1-antichymotrypsin dbr:Alpha_2-antiplasmin dbr:Alzheimer's_disease dbr:Eukaryote dbr:Eukaryotes dbr:Extremophile dbr:Factor_XI dbr:Fondaparinux dbr:Angiotensinogen dbr:Osteogenesis_imperfecta dbr:Ovalbumin dbr:Palmoplantar_keratoderma dbr:Cell_death dbr:Cell_signaling dbr:Cellulosome dbr:Centroacinar_cell dbr:Chromatin_remodeling dbr:Chromosome dbr:Chymase dbr:Chymotrypsin dbr:Familial_encephalopathy_with_neuroserpin_inclusion_bodies dbr:Folding_(chemistry) dbr:Golgi_apparatus dbr:Granule_(cell_biology) dbr:Granzyme_B dbr:Kallistatin dbr:Knockout_mouse dbr:Prenatal_development dbr:Protein_dimer dbr:Protein_domain dbr:Protein_folding dbr:Poxviridae dbr:Protease dbr:Protein dbr:Rabbitpox dbr:Red_blood_cell dbr:Heparin dbr:Hydrolysis dbr:SERPINB1 dbr:SERPINE2 dbr:Uterine_serpin dbr:Asthma dbc:Protein_superfamilies dbc:Serine_protease_inhibitors dbr:Katholieke_Universiteit_Leuven dbr:Kingdom_(biology) dbr:Laurasiatheria dbr:Biomolecular_structure dbr:Bleeding dbr:Coagulation dbr:Cofactor_(biochemistry) dbr:Collagen dbr:Egg_white dbr:Heparin_cofactor_II dbr:Hepatocyte dbr:Hereditary_angioedema dbr:Protein_trimer dbr:Thrombin dbr:Protein_Z-related_protease_inhibitor dbr:Immune_responses dbr:C-terminus dbr:Phylogenetic dbr:Plant dbr:Plants dbr:Polymer dbr:Polymerisation dbr:Spp. dbr:Fibrinolysis dbr:Antithrombin_deficiency dbr:Antitrypsin-related_protein dbr:Factor_Xa dbr:HSP47 dbr:Kunitz-type_protease_inhibitor dbr:Nematode dbr:Organ_transplantation dbr:Caspase dbr:Cathepsin_G dbr:Chaperone_(protein) dbr:Serine dbr:X-ray_crystallography dbr:Myeloid_and_erythroid_nuclear_termination_stage_specific_protein dbr:Virus dbr:Neocallimastigomycota dbr:Neutropenia dbr:Factor_IX dbr:Factor_X dbr:Lysosome dbr:Trypsin dbr:Pneumatosis dbr:Myeloid_and_erythroid_nuclear_termination_stage-specific_protein dbr:N-terminus dbr:SERPINB6 dbr:SERPINA2 dbr:SERPINB4 dbr:Serine_protease dbr:SERPINB10 dbr:Interleukin_1_family dbr:SERPINB3 dbr:SERPINA9 dbr:Thrombosis dbr:Storage_protein dbr:SERPINA6 dbr:SERPINB9 dbr:PHLPP dbr:Β-sheet dbr:SERPINB13 dbr:SERPINB7 dbr:SERPINB8 dbr:Squamous_cell_carcinoma dbr:PAI-1 dbr:SERPINA1 dbr:SERPINA10 dbr:SERPINA3 dbr:SERPINA5 dbr:SERPINA7 dbr:SERPINA8 dbr:SERPINB2 dbr:SERPINB5 dbr:SERPINC1 dbr:SERPIND1 dbr:SERPINE1 dbr:SERPINF1 dbr:SERPINF2 dbr:SERPING1 dbr:SERPINH1 dbr:Carriage_proteins dbr:Centerin dbr:Human_neutrophil_elastase dbr:Blood_clotting dbr:Signalling_cascade dbr:Acyl-enzyme_intermediate dbr:Suicide_inhibitor dbr:47_kDa_Heat_shock_protein dbr:Nucleophilic_attack dbr:Plasminogen_activator_inhibitor_1 dbr:Null_mutation dbr:Molecular_chaperone dbr:Exosite_(biology) dbr:Hereditary_disease dbr:Homolog dbr:Irreversible_inhibition dbr:Megsin dbr:Neofunctionalisation dbr:Α1-antitrypsin dbr:Β_strands dbr:Squamous_cell_carcinoma_antigen-1 dbr:Squamous_cell_carcinoma_antigen-2 dbr:Vaspin dbr:File:Serpin_activation_by_heparin_(unannotated).png dbr:File:Serpin_and_protease.png dbr:File:Serpin_delta_conformation.png dbr:File:Serpin_equilibrium.png dbr:File:Serpin_latent_state_(unannotated).png dbr:SERPINA13 dbr:Yukopin dbr:SERPINA11 dbr:SERPINA12 dbr:SERPINB11 dbr:SERPINB12 |
| dbp:align | center (en) |
| dbp:alt | Conformational change diagram (en) Diagram of a domain-swapped serpin dimer (en) Diagram of a domain-swapped serpin trimer (en) Serpin mechanism diagram (en) |
| dbp:caption | The inhibitory mechanism of serpins involves a large conformational change . The serpin first binds a protease with the exposed reactive centre loop . When this loop is cleaved by the protease, it rapidly inserts into the A-sheet , deforming and inhibiting the protease. (en) Serine and cysteine proteases operate by a two-step catalytic mechanism. First, the substrate is attacked by the cysteine or serine of the catalytic triad to form an acyl-enzyme intermediate. For typical substrates, the intermediate is resolved by hydrolysis by water. However, when the reactive centre loop of a serpin is attacked, the conformational change pulls the catalytic triad out of position, preventing it from completing catalysis. (en) A domain-swapped serpin dimer. (en) A serpin with its 'reactive centre loop' bound to a protease . Once the protease attempts catalysis it will be irreversibly inhibited. (en) A domain-swapped serpin trimer. Each monomer's RCL is inserted into its own structure . (en) |
| dbp:cdd | cd00172 (en) |
| dbp:date | 2016-10-30 (xsd:date) |
| dbp:direction | vertical (en) |
| dbp:header | Serpin polymerisation by domain swapping (en) |
| dbp:image | Antitrypsindomswap.png (en) Domainswappeddimer.png (en) Serpin mechanism .png (en) Serpin mechanism.png (en) |
| dbp:interpro | IPR000215 (en) |
| dbp:name | Serpin (en) |
| dbp:pdb | A:1-378 B:349-379 A:1-415 A:1-415 A:1-385 A:1-385 B:1-385 B:77-433 L:76-461 I:76-461 L:76-461 I:76-461 L:76-461 L:76-461 L:76-461 L:76-461 L:76-461 L:76-461 A:78-461 I:76-461 I:76-461p I:76-461 L:76-461 I:76-461 A:76-461 I:76-461 A:1-375 B:1-375 B:1-375 A:1-375 A:1-300 A:1-55 A:1-305 I:18-392 :18-369 :45-415 B:383-415 A:43-382 A:49-376 A:43-415 A:43-415 B:378-415 A:44-382 A:43-415 A:43-415 :44-415 A:43-382 B:383-415 :47-415 A:43-415 A:50-383 A:43-420 B:390-420 A:47-383 A:48-383 B:42-417 F:376-406 B:374-406 B:374-406 A:119-496 A:119-496 A:25-402 A:25-402 D:25-402 D:25-402 A:25-402 A:25-402 B:26-402 A:25-402 A:25-402 A:138-498 D:101-361 A:49-415 (en) |
| dbp:pfam | PF00079 (en) |
| dbp:prosite | PDOC00256 (en) |
| dbp:scop | 1 (xsd:integer) |
| dbp:symbol | Serpin, SERPIN (en) |
| dbp:url | https://web.archive.org/web/20161030180728/http:/huntingtonlab.cimr.cam.ac.uk/ |
| dbp:width | 280 (xsd:integer) 400 (xsd:integer) 484 (xsd:integer) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Featured_article dbt:MeshName dbt:Multiple_image dbt:Portal dbt:Proper_name dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Use_dmy_dates dbt:Webarchive dbt:PDB2 dbt:PDB_Molecule_of_the_Month dbt:Serpins dbt:PDB dbt:PDB3 dbt:PDBe-KB2 dbt:Pfam_box |
| dct:subject | dbc:Protein_superfamilies dbc:Serine_protease_inhibitors |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 yago:Abstraction100002137 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Group100031264 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:Protein yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteinGroups yago:WikicatProteins |
| rdfs:comment | Serpin atau Serine Protease Inhibitor adalah sebuah kelompok besar protein yang bekerja sebagai penghambat protease dan merupakan penghambat protease terbesar dan paling banyak ditemui pada makhluk hidup. Gen yang menyerupai serpin telah ditemukan pada binatang, tumbuhan, dan bakteri. Serpin bekerja dengan cara mengubah bentuk untuk menghambat enzim target. (in) Gli inibitori delle serin proteasi o serpine sono stati il primo gruppo di proteine, aventi struttura simile, a essere identificate come capaci di inibire le serin proteasi. Il nome serpina è un acronimo dell'inglese serine protease inhibitors (inibitori delle proteasi a serina). Le serpine, essendo molto numerose, formano una superfamiglia di proteine. (it) Серпины (англ. Serpins, сокращение от англ. serine protease inhibitors, «ингибиторы сериновых протеаз») — группа белков, которые имеют определённое структурное сходство между собой и многие из которых ингибируют сериновые протеазы, то есть протеазы, имеющие серин в активном центре. (ru) السربين هي مجموعة من البروتينات ذات الهياكل المتماثلة والتي تم تحديدها أولا أنها مجموعة من البروتينات القادرة على تثبيط البروتياز (البيتيداز)، وقد اُبتكرت ترخيمة السربين لأن العديد من السربينات تثبط الكيموتربسين (أنزيم بيتيدي بنكرياسي) مثل سيرين البورتياز (مثبطات سيرين البورتياز). (ar) Las serpinas (del inglés, serine protease inhibitors) son una superfamilia de proteínas caracterizadas principalmente por ser , ampliamente distribuida en los seres vivos ya que se pueden encontrar en todos los eucariotas y en algunos procariotas. Si bien la mayoría de las serpinas tienen la función de inhibir serina proteasas, otras inhiben caspasas, y como la papaína. También se encuentran serpinas con otras funciones tales como el transporte de hormonas, chaperonas moleculares o la supresión de tumores. (es) Serpine sind Proteine, die in allen Lebewesen vorkommen; beim Menschen machen sie etwa zehn Prozent der Plasmaproteine aus. Sie sind strukturell ähnliche Proteine, welche unterschiedliche Funktionen ausüben können. Die ursprünglich entdeckten Serpine sind in der Lage, die Enzymaktivität von Serinproteinasen zu blockieren (Serpin = Serin-Proteinase-Inhibitoren), diese Eigenschaft besitzen viele andere Serpine jedoch nicht. Zu den Serpinen gehören Antitrypsin, Antithrombin, Ovalbumin, Plasminogen-Aktivator-Inhibitor und . Ihre Aufgabe ist hauptsächlich die Regulation der Protease-Aktivität. Die Proteindatenbank UniProt zählt über 40 gesicherte Mitglieder der Serpin-Familie, über 80 Sequenzen sind bekannt. (de) Les serpines (de l'anglais serpin, mot-valise pour serine protease inhibitor) sont des protéines aux structures semblables, connues historiquement pour leur capacité à inhiber les protéases à sérine. Elles forment une superfamille de protéines présente à travers tous les règnes du vivant. Elles doivent leur nom au fait que les premières à avoir été identifiées inhibent les protéases à sérine de type chymotrypsine. Elles sont remarquables par leur mécanisme d'action, qui consiste à inhiber leur peptidase cible en subissant un changement conformationnel de grande amplitude qui fait disparaître le site actif. Ce mécanisme est très différent du mécanisme compétitif plus courant des inhibiteurs de protéases, qui se lient au site actif de l'enzyme, et empêchent la catalyse d'avoir lieu. (fr) Serpins are a superfamily of proteins with similar structures that were first identified for their protease inhibition activity and are found in all kingdoms of life. The acronym serpin was originally coined because the first serpins to be identified act on chymotrypsin-like serine proteases (serine protease inhibitors). They are notable for their unusual mechanism of action, in which they irreversibly inhibit their target protease by undergoing a large conformational change to disrupt the target's active site. This contrasts with the more common competitive mechanism for protease inhibitors that bind to and block access to the protease active site. (en) セルピン（セリンプロテアーゼインヒビター、セリンプロテアーゼ阻害剤、英: Serpin）は、最初にプロテアーゼ阻害効果を持つ事で同定された類似構造を持つタンパク質のスーパーファミリーで、全ての界の生物で発見される。セルピン (serpin) の略名は元々最初に同定されたセルピンがキモトリプシン様セリンプロテアーゼに対して働く (serine protease inhibitors) ために名付けられた造語である。特筆すべきはセルピンの珍しい活性機構であり、セルピンは立体構造の大きな変化を受ける事でプロテアーゼの活性中心を破壊し、標的を不可逆的に阻害する。この阻害機構は他の一般的なプロテアーゼ阻害剤が競合的阻害剤で、酵素と結合して活性中心を塞ぐ事で働くのと対照的である。 ほとんどのセルピンはタンパク質の分解反応を制御するが、中にはセルピンの構造を持ちながら酵素阻害剤として働かず、貯蔵（卵白中のオボアルブミンのように）や、ホルモンの輸送タンパク質（チロキシン結合グロブリンやトランスコルチン）のように運搬に関わったり、分子シャペロン（ヒートショックプロテイン47）として働くものもある。以上のようなタンパク質は阻害剤として働かないにも関わらず、進化学的に近縁なため、セルピンという語句はセリンプロテアーゼの阻害剤以外にも使われる。 (ja) Serpiny – nadrodzina białek o podobnej strukturze, zidentyfikowanych po raz pierwszy dzięki ich aktywności hamowania proteaz. Występują we wszystkich królestwach organizmów żywych. Akronim stanowiący ich nazwę ukuto, ponieważ pierwsze zidentyfikowane serpiny działały jako inhibitory proteaz serynowych przypominających chymotrypsynę (serine protease inhibitors). Znane są z niezwykłego mechanizmu działania, inhibicji nieodwracalnej. Doprowadzają proteazy do znacznej zmiany konformacji, niszcząc miejsce aktywne. Kontrastuje to z bardziej powszechnym mechanizmem inhibicji kompetycyjnej proteaz, w którym inhibitor przyłącza się do miejsca aktywnego enzymu i blokuje je. (pl) Serpiner är en grupp proteiner med liknande uppbyggnad som blockerar proteaser, dvs enzymer som bryter ned proteiner. Namnet kommer av att de först upptäcka serpinerna blockerar kymotrypsin-liknande serinproteas (därav förkortningen serine protease inhibitors). (sv) As serpinas são uma superfamília de proteínas com estruturas semelhantes que foram identificadas pela inibição da protease e podem ser encontradas em todos os reinos. O acrónimo serpina foi cunhado porque as primeiras serpinas a serem identificadas actuavam como quimotripsina serina-protease (serina protease inibidora). Destacam-se pelo seu inusitado mecanismo de acção, no qual inibem irreversivelmente a sua protease alvo, ao submeterem-se a uma grande para alterar o seu sítio activo. Isto contrasta com o mecanismo mais comum dos inibidores de protease que se ligam e bloqueiam o acesso da protease ao sítio activo. (pt) 丝氨酸蛋白酶抑制剂（英語：serpin；serine protease inhibitors）是具有相似结构蛋白质的蛋白质超家族，它是由于蛋白酶抑制活性被识别的，和在生命的各个界被发现的第一个蛋白质超家族。英文缩写丝氨酸蛋白酶抑制剂（英語：serpin）最初被创造，是因为第一个丝氨酸蛋白酶抑制剂对胰凝乳蛋白酶样丝氨酸蛋白酶（丝氨酸蛋白酶抑制剂）将要被识别的行为。它们值得注意的是其动作的不同寻常的机制，它们不可逆地通过经历大的构象改变，扰乱其活性位点抑制它们的靶蛋白酶。与此相反，通过对于结合并阻止访问蛋白酶活性位点的蛋白酶抑制剂是更常见的机制。 由丝氨酸蛋白酶抑制剂的蛋白酶抑制控制的一系列生物过程，包括凝血和炎症，因此这些蛋白质是医学研究的目标。对于结构生物学和蛋白质折叠研究社区，它们独特的构象变化也使它们成为研究的兴趣。构象变化机制赋予某些优点，但是它也具有缺点：丝氨酸蛋白酶抑制剂易受到突变的影响，所述突变可导致丝氨酸蛋白酶抑制剂病例如蛋白质错误折叠（Proteopathy）和形成无活性的长链聚合物。丝氨酸蛋白酶抑制剂聚合不仅减少活性抑制剂的量，而且导致聚合物的积聚，引起细胞死亡和器官衰竭。 (zh) |
| rdfs:label | سربين (ar) Serpine (de) Serpina (es) Serpine (fr) Serpin (in) Inibitore della serin proteasi (it) セルピン (ja) Serpiny (pl) Serpin (en) Серпин (ru) Serpina (pt) Serpin (sv) 丝氨酸蛋白酶抑制剂 (zh) |
| owl:sameAs | freebase:Serpin yago-res:Serpin wikidata:Serpin dbpedia-ar:Serpin dbpedia-de:Serpin dbpedia-es:Serpin dbpedia-fa:Serpin dbpedia-fr:Serpin dbpedia-he:Serpin dbpedia-id:Serpin dbpedia-it:Serpin dbpedia-ja:Serpin dbpedia-pl:Serpin dbpedia-pt:Serpin dbpedia-ru:Serpin dbpedia-sr:Serpin dbpedia-sv:Serpin dbpedia-th:Serpin dbpedia-zh:Serpin https://global.dbpedia.org/id/3tHoB |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Serpin?oldid=1104040210&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Antitrypsindomswap.png wiki-commons:Special:FilePath/Domainswappeddimer.png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_activation_by_heparin_(unannotated).png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_and_protease.png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_delta_conformation.png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_equilibrium.png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_latent_state_(unannotated).png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_mechanism.png wiki-commons:Special:FilePath/Serpin_mechanism_(S_to_R).png wiki-commons:Special:FilePath/serpin_(stressed).png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Serpin |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Serine_protease_inhibitor dbr:Serine_protease_inhibitors dbr:Serpin_family dbr:Serpin_peptidase_inhibitor dbr:Serpin_superfamily dbr:Serpinopathies dbr:Serpinopathy dbr:Serpins dbr:Table_of_human_serpins |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Enzyme_inhibitor dbr:Antithrombin dbr:Urokinase dbr:Index_of_biochemistry_articles dbr:Inhibitor_of_apoptosis dbr:L1_(protein) dbr:KLK14 dbr:SERPIN_A12 dbr:Gene_nomenclature dbr:Vitronectin dbr:Proteolysis dbr:Transcortin dbr:Tiplasinin dbr:Aprotinin dbr:Yu_Myeong-Hee dbr:Plasminogen_activator_inhibitor-1 dbr:Plasminogen_activator_inhibitor-2 dbr:Protein_C_inhibitor dbr:Thyroxine-binding_globulin dbr:Maspin dbr:C1-inhibitor dbr:Actinic_keratosis dbr:Acute-phase_protein dbr:Heat_shock_protein_47 dbr:Neutrophil_elastase dbr:Albumin dbr:Alpha-1_antitrypsin dbr:Cysteine_protease dbr:Alpha_1-antichymotrypsin dbr:Alpha_2-antiplasmin dbr:Angiotensin dbr:Nicholas_Hastie dbr:Ovalbumin dbr:Kallistatin dbr:Protease dbr:SERPINB1 dbr:SERPINE2 dbr:Uterine_serpin dbr:Coagulation dbr:Hoof_wall_separation_disease dbr:Thrombin dbr:Piers_Nash dbr:Randy_Read dbr:MENT dbr:Myeloid_and_erythroid_nuclear_termination_stage-specific_protein dbr:Peeling_skin_syndrome dbr:SERPINB6 dbr:SERPINA2 dbr:SERPINB4 dbr:SERPINB10 dbr:SERPINB3 dbr:SERPINA9 dbr:SERPINB9 dbr:Trypanosoma_brucei dbr:Rhomboid_protease dbr:PEDF dbr:Neuroserpin dbr:Trypsin_inhibitor dbr:SERPINB13 dbr:SERPINB7 dbr:SERPINB8 dbr:Serine_protease_inhibitor dbr:Serine_protease_inhibitors dbr:Serpin_family dbr:Serpin_peptidase_inhibitor dbr:Serpin_superfamily dbr:Serpinopathies dbr:Serpinopathy dbr:Serpins dbr:Table_of_human_serpins |
| is gold:hypernym of | dbr:Heat_shock_protein_47 |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Serpin |
